Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
VPS72Q15906 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
VPS72Q15906 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
VPS72Q15906 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
VPS72Q15906 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
VPS72Q15906 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
VPS72Q15906 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
VPS72Q15906 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
VPS72Q15906 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
VPS72Q15906 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
VPS72Q15906 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
VPS72Q15906 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
VPS72Q15906 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
VPS72Q15906 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
VPS72Q15906 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
VPS72Q15906 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
VPS72Q15906 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
VPS72Q15906 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
VPS72Q15906 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
VPS72Q15906 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
VPS72Q15906 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
VPS72Q15906 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
VPS72Q15906 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
VPS72Q15906 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
VPS72Q15906 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
VPS72Q15906 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC34.32■■■■□ 3.08
VPS72Q15906 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
VPS72Q15906 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
VPS72Q15906 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
VPS72Q15906 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
VPS72Q15906 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
VPS72Q15906 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
VPS72Q15906 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
VPS72Q15906 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
VPS72Q15906 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
VPS72Q15906 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
VPS72Q15906 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
VPS72Q15906 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
VPS72Q15906 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
VPS72Q15906 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
VPS72Q15906 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
VPS72Q15906 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
VPS72Q15906 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
VPS72Q15906 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
VPS72Q15906 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
VPS72Q15906 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
VPS72Q15906 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
VPS72Q15906 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
VPS72Q15906 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
VPS72Q15906 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
VPS72Q15906 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
VPS72Q15906 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
VPS72Q15906 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
VPS72Q15906 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
VPS72Q15906 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
VPS72Q15906 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
VPS72Q15906 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
VPS72Q15906 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
VPS72Q15906 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
VPS72Q15906 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
VPS72Q15906 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
VPS72Q15906 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
VPS72Q15906 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
VPS72Q15906 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
VPS72Q15906 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
VPS72Q15906 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
VPS72Q15906 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
VPS72Q15906 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
VPS72Q15906 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
VPS72Q15906 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC34.2■■■■□ 3.07
VPS72Q15906 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC34.2■■■■□ 3.06
VPS72Q15906 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
VPS72Q15906 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
VPS72Q15906 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
VPS72Q15906 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
VPS72Q15906 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
VPS72Q15906 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
VPS72Q15906 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
VPS72Q15906 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
VPS72Q15906 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
VPS72Q15906 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
VPS72Q15906 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
VPS72Q15906 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
VPS72Q15906 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
VPS72Q15906 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
VPS72Q15906 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
VPS72Q15906 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
VPS72Q15906 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
VPS72Q15906 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
VPS72Q15906 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
VPS72Q15906 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
VPS72Q15906 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
VPS72Q15906 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
VPS72Q15906 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
VPS72Q15906 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
VPS72Q15906 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
VPS72Q15906 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
VPS72Q15906 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
VPS72Q15906 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
VPS72Q15906 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms