Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEDD8Q15843 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEDD8Q15843 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEDD8Q15843 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEDD8Q15843 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEDD8Q15843 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEDD8Q15843 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEDD8Q15843 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEDD8Q15843 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEDD8Q15843 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEDD8Q15843 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEDD8Q15843 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NEDD8Q15843 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEDD8Q15843 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEDD8Q15843 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEDD8Q15843 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEDD8Q15843 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEDD8Q15843 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEDD8Q15843 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NEDD8Q15843 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEDD8Q15843 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEDD8Q15843 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEDD8Q15843 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEDD8Q15843 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEDD8Q15843 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NEDD8Q15843 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
NEDD8Q15843 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NEDD8Q15843 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEDD8Q15843 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NEDD8Q15843 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEDD8Q15843 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEDD8Q15843 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEDD8Q15843 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEDD8Q15843 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEDD8Q15843 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEDD8Q15843 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEDD8Q15843 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEDD8Q15843 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEDD8Q15843 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEDD8Q15843 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEDD8Q15843 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEDD8Q15843 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEDD8Q15843 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEDD8Q15843 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEDD8Q15843 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEDD8Q15843 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEDD8Q15843 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NEDD8Q15843 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEDD8Q15843 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEDD8Q15843 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEDD8Q15843 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEDD8Q15843 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEDD8Q15843 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NEDD8Q15843 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEDD8Q15843 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEDD8Q15843 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEDD8Q15843 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NEDD8Q15843 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEDD8Q15843 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEDD8Q15843 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEDD8Q15843 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEDD8Q15843 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEDD8Q15843 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEDD8Q15843 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEDD8Q15843 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NEDD8Q15843 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEDD8Q15843 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NEDD8Q15843 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEDD8Q15843 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEDD8Q15843 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NEDD8Q15843 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEDD8Q15843 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEDD8Q15843 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEDD8Q15843 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEDD8Q15843 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NEDD8Q15843 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NEDD8Q15843 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEDD8Q15843 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NEDD8Q15843 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEDD8Q15843 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEDD8Q15843 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEDD8Q15843 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEDD8Q15843 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEDD8Q15843 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEDD8Q15843 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEDD8Q15843 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEDD8Q15843 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEDD8Q15843 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEDD8Q15843 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEDD8Q15843 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEDD8Q15843 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEDD8Q15843 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEDD8Q15843 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEDD8Q15843 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEDD8Q15843 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEDD8Q15843 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEDD8Q15843 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEDD8Q15843 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEDD8Q15843 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEDD8Q15843 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
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