Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TAF1AQ15573 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TAF1AQ15573 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TAF1AQ15573 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TAF1AQ15573 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TAF1AQ15573 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TAF1AQ15573 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TAF1AQ15573 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TAF1AQ15573 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TAF1AQ15573 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TAF1AQ15573 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TAF1AQ15573 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TAF1AQ15573 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TAF1AQ15573 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TAF1AQ15573 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TAF1AQ15573 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TAF1AQ15573 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TAF1AQ15573 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TAF1AQ15573 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TAF1AQ15573 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TAF1AQ15573 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TAF1AQ15573 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TAF1AQ15573 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TAF1AQ15573 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TAF1AQ15573 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TAF1AQ15573 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TAF1AQ15573 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TAF1AQ15573 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TAF1AQ15573 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TAF1AQ15573 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TAF1AQ15573 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TAF1AQ15573 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TAF1AQ15573 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TAF1AQ15573 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TAF1AQ15573 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TAF1AQ15573 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TAF1AQ15573 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TAF1AQ15573 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TAF1AQ15573 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TAF1AQ15573 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TAF1AQ15573 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TAF1AQ15573 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TAF1AQ15573 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TAF1AQ15573 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TAF1AQ15573 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TAF1AQ15573 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TAF1AQ15573 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TAF1AQ15573 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TAF1AQ15573 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TAF1AQ15573 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TAF1AQ15573 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TAF1AQ15573 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TAF1AQ15573 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TAF1AQ15573 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TAF1AQ15573 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TAF1AQ15573 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TAF1AQ15573 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TAF1AQ15573 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TAF1AQ15573 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TAF1AQ15573 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TAF1AQ15573 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TAF1AQ15573 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TAF1AQ15573 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TAF1AQ15573 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TAF1AQ15573 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TAF1AQ15573 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TAF1AQ15573 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TAF1AQ15573 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TAF1AQ15573 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TAF1AQ15573 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TAF1AQ15573 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TAF1AQ15573 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TAF1AQ15573 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TAF1AQ15573 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TAF1AQ15573 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TAF1AQ15573 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TAF1AQ15573 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TAF1AQ15573 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TAF1AQ15573 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TAF1AQ15573 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TAF1AQ15573 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TAF1AQ15573 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TAF1AQ15573 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TAF1AQ15573 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TAF1AQ15573 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TAF1AQ15573 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TAF1AQ15573 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TAF1AQ15573 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TAF1AQ15573 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TAF1AQ15573 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TAF1AQ15573 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TAF1AQ15573 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TAF1AQ15573 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TAF1AQ15573 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TAF1AQ15573 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TAF1AQ15573 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TAF1AQ15573 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TAF1AQ15573 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TAF1AQ15573 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TAF1AQ15573 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
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