Protein–RNA interactions for Protein: Q15428

SF3A2, Splicing factor 3A subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A2Q15428 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SF3A2Q15428 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SF3A2Q15428 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SF3A2Q15428 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SF3A2Q15428 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SF3A2Q15428 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SF3A2Q15428 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SF3A2Q15428 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SF3A2Q15428 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SF3A2Q15428 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SF3A2Q15428 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SF3A2Q15428 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SF3A2Q15428 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SF3A2Q15428 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SF3A2Q15428 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SF3A2Q15428 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SF3A2Q15428 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SF3A2Q15428 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SF3A2Q15428 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SF3A2Q15428 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SF3A2Q15428 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SF3A2Q15428 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SF3A2Q15428 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SF3A2Q15428 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SF3A2Q15428 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SF3A2Q15428 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SF3A2Q15428 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SF3A2Q15428 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SF3A2Q15428 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SF3A2Q15428 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SF3A2Q15428 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SF3A2Q15428 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SF3A2Q15428 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SF3A2Q15428 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SF3A2Q15428 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SF3A2Q15428 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SF3A2Q15428 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SF3A2Q15428 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SF3A2Q15428 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SF3A2Q15428 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SF3A2Q15428 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SF3A2Q15428 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SF3A2Q15428 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SF3A2Q15428 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SF3A2Q15428 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SF3A2Q15428 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SF3A2Q15428 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SF3A2Q15428 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SF3A2Q15428 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SF3A2Q15428 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SF3A2Q15428 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SF3A2Q15428 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SF3A2Q15428 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SF3A2Q15428 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SF3A2Q15428 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SF3A2Q15428 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SF3A2Q15428 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SF3A2Q15428 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SF3A2Q15428 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SF3A2Q15428 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SF3A2Q15428 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SF3A2Q15428 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SF3A2Q15428 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SF3A2Q15428 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SF3A2Q15428 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SF3A2Q15428 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SF3A2Q15428 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SF3A2Q15428 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SF3A2Q15428 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SF3A2Q15428 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SF3A2Q15428 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SF3A2Q15428 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SF3A2Q15428 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SF3A2Q15428 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SF3A2Q15428 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SF3A2Q15428 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SF3A2Q15428 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SF3A2Q15428 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SF3A2Q15428 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SF3A2Q15428 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SF3A2Q15428 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SF3A2Q15428 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SF3A2Q15428 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SF3A2Q15428 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SF3A2Q15428 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SF3A2Q15428 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SF3A2Q15428 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SF3A2Q15428 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SF3A2Q15428 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SF3A2Q15428 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SF3A2Q15428 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SF3A2Q15428 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SF3A2Q15428 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SF3A2Q15428 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SF3A2Q15428 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SF3A2Q15428 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SF3A2Q15428 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SF3A2Q15428 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SF3A2Q15428 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SF3A2Q15428 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
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