Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCF4Q15080 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NCF4Q15080 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCF4Q15080 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCF4Q15080 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCF4Q15080 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCF4Q15080 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCF4Q15080 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCF4Q15080 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCF4Q15080 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCF4Q15080 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCF4Q15080 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCF4Q15080 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCF4Q15080 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCF4Q15080 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCF4Q15080 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCF4Q15080 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCF4Q15080 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCF4Q15080 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCF4Q15080 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCF4Q15080 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCF4Q15080 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCF4Q15080 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCF4Q15080 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCF4Q15080 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCF4Q15080 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCF4Q15080 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCF4Q15080 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCF4Q15080 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCF4Q15080 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCF4Q15080 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCF4Q15080 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCF4Q15080 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCF4Q15080 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCF4Q15080 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCF4Q15080 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCF4Q15080 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCF4Q15080 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCF4Q15080 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCF4Q15080 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCF4Q15080 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCF4Q15080 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCF4Q15080 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCF4Q15080 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NCF4Q15080 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCF4Q15080 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCF4Q15080 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NCF4Q15080 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCF4Q15080 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCF4Q15080 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCF4Q15080 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCF4Q15080 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCF4Q15080 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCF4Q15080 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCF4Q15080 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCF4Q15080 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCF4Q15080 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCF4Q15080 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCF4Q15080 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCF4Q15080 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCF4Q15080 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCF4Q15080 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCF4Q15080 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCF4Q15080 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCF4Q15080 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCF4Q15080 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCF4Q15080 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCF4Q15080 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NCF4Q15080 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCF4Q15080 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCF4Q15080 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCF4Q15080 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCF4Q15080 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCF4Q15080 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCF4Q15080 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCF4Q15080 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCF4Q15080 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCF4Q15080 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCF4Q15080 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCF4Q15080 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCF4Q15080 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCF4Q15080 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCF4Q15080 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCF4Q15080 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCF4Q15080 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCF4Q15080 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCF4Q15080 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCF4Q15080 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCF4Q15080 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCF4Q15080 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NCF4Q15080 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCF4Q15080 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCF4Q15080 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCF4Q15080 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCF4Q15080 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCF4Q15080 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NCF4Q15080 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCF4Q15080 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCF4Q15080 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCF4Q15080 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
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