Protein–RNA interactions for Protein: Q15036

SNX17, Sorting nexin-17, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17Q15036 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SNX17Q15036 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SNX17Q15036 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SNX17Q15036 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SNX17Q15036 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SNX17Q15036 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SNX17Q15036 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SNX17Q15036 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SNX17Q15036 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SNX17Q15036 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SNX17Q15036 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SNX17Q15036 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SNX17Q15036 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SNX17Q15036 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
SNX17Q15036 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SNX17Q15036 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SNX17Q15036 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SNX17Q15036 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SNX17Q15036 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SNX17Q15036 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SNX17Q15036 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
SNX17Q15036 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SNX17Q15036 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SNX17Q15036 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SNX17Q15036 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SNX17Q15036 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SNX17Q15036 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SNX17Q15036 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SNX17Q15036 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SNX17Q15036 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SNX17Q15036 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SNX17Q15036 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SNX17Q15036 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SNX17Q15036 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SNX17Q15036 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SNX17Q15036 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SNX17Q15036 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SNX17Q15036 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SNX17Q15036 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SNX17Q15036 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SNX17Q15036 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SNX17Q15036 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SNX17Q15036 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SNX17Q15036 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SNX17Q15036 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SNX17Q15036 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SNX17Q15036 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SNX17Q15036 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SNX17Q15036 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SNX17Q15036 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SNX17Q15036 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SNX17Q15036 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SNX17Q15036 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SNX17Q15036 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SNX17Q15036 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SNX17Q15036 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SNX17Q15036 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SNX17Q15036 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SNX17Q15036 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SNX17Q15036 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SNX17Q15036 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SNX17Q15036 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SNX17Q15036 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SNX17Q15036 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SNX17Q15036 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SNX17Q15036 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SNX17Q15036 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SNX17Q15036 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SNX17Q15036 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SNX17Q15036 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SNX17Q15036 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SNX17Q15036 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SNX17Q15036 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SNX17Q15036 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SNX17Q15036 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SNX17Q15036 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SNX17Q15036 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SNX17Q15036 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SNX17Q15036 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SNX17Q15036 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SNX17Q15036 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SNX17Q15036 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SNX17Q15036 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SNX17Q15036 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SNX17Q15036 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SNX17Q15036 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SNX17Q15036 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SNX17Q15036 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SNX17Q15036 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SNX17Q15036 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SNX17Q15036 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SNX17Q15036 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SNX17Q15036 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SNX17Q15036 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SNX17Q15036 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SNX17Q15036 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SNX17Q15036 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SNX17Q15036 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SNX17Q15036 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SNX17Q15036 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms