Protein–RNA interactions for Protein: Q14994

NR1I3, Nuclear receptor subfamily 1 group I member 3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1I3Q14994 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NR1I3Q14994 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NR1I3Q14994 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NR1I3Q14994 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NR1I3Q14994 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NR1I3Q14994 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NR1I3Q14994 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NR1I3Q14994 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NR1I3Q14994 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NR1I3Q14994 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NR1I3Q14994 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NR1I3Q14994 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NR1I3Q14994 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NR1I3Q14994 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NR1I3Q14994 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NR1I3Q14994 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NR1I3Q14994 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NR1I3Q14994 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NR1I3Q14994 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
NR1I3Q14994 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
NR1I3Q14994 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NR1I3Q14994 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NR1I3Q14994 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NR1I3Q14994 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NR1I3Q14994 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NR1I3Q14994 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
NR1I3Q14994 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NR1I3Q14994 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NR1I3Q14994 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NR1I3Q14994 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NR1I3Q14994 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NR1I3Q14994 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NR1I3Q14994 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NR1I3Q14994 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NR1I3Q14994 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NR1I3Q14994 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NR1I3Q14994 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NR1I3Q14994 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NR1I3Q14994 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NR1I3Q14994 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NR1I3Q14994 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NR1I3Q14994 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
NR1I3Q14994 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NR1I3Q14994 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NR1I3Q14994 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NR1I3Q14994 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NR1I3Q14994 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NR1I3Q14994 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NR1I3Q14994 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NR1I3Q14994 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
NR1I3Q14994 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NR1I3Q14994 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NR1I3Q14994 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NR1I3Q14994 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NR1I3Q14994 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NR1I3Q14994 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NR1I3Q14994 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NR1I3Q14994 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NR1I3Q14994 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NR1I3Q14994 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NR1I3Q14994 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NR1I3Q14994 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NR1I3Q14994 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NR1I3Q14994 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NR1I3Q14994 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
NR1I3Q14994 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NR1I3Q14994 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NR1I3Q14994 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NR1I3Q14994 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NR1I3Q14994 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NR1I3Q14994 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NR1I3Q14994 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NR1I3Q14994 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NR1I3Q14994 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NR1I3Q14994 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NR1I3Q14994 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
NR1I3Q14994 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NR1I3Q14994 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NR1I3Q14994 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
NR1I3Q14994 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NR1I3Q14994 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NR1I3Q14994 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NR1I3Q14994 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NR1I3Q14994 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NR1I3Q14994 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NR1I3Q14994 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NR1I3Q14994 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NR1I3Q14994 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NR1I3Q14994 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NR1I3Q14994 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NR1I3Q14994 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NR1I3Q14994 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NR1I3Q14994 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NR1I3Q14994 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NR1I3Q14994 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NR1I3Q14994 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
NR1I3Q14994 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NR1I3Q14994 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
NR1I3Q14994 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.57■■■□□ 2
NR1I3Q14994 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
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