Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GPNMBQ14956 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GPNMBQ14956 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GPNMBQ14956 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
GPNMBQ14956 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GPNMBQ14956 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GPNMBQ14956 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GPNMBQ14956 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GPNMBQ14956 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GPNMBQ14956 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GPNMBQ14956 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
GPNMBQ14956 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
GPNMBQ14956 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GPNMBQ14956 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GPNMBQ14956 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GPNMBQ14956 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GPNMBQ14956 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GPNMBQ14956 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GPNMBQ14956 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GPNMBQ14956 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GPNMBQ14956 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GPNMBQ14956 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GPNMBQ14956 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GPNMBQ14956 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GPNMBQ14956 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GPNMBQ14956 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GPNMBQ14956 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GPNMBQ14956 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GPNMBQ14956 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
GPNMBQ14956 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GPNMBQ14956 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GPNMBQ14956 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GPNMBQ14956 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GPNMBQ14956 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GPNMBQ14956 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GPNMBQ14956 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GPNMBQ14956 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
GPNMBQ14956 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GPNMBQ14956 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GPNMBQ14956 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GPNMBQ14956 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GPNMBQ14956 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GPNMBQ14956 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GPNMBQ14956 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GPNMBQ14956 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GPNMBQ14956 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GPNMBQ14956 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GPNMBQ14956 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GPNMBQ14956 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GPNMBQ14956 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GPNMBQ14956 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GPNMBQ14956 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
GPNMBQ14956 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GPNMBQ14956 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
GPNMBQ14956 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GPNMBQ14956 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GPNMBQ14956 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GPNMBQ14956 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GPNMBQ14956 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GPNMBQ14956 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GPNMBQ14956 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GPNMBQ14956 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GPNMBQ14956 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GPNMBQ14956 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GPNMBQ14956 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GPNMBQ14956 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GPNMBQ14956 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GPNMBQ14956 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GPNMBQ14956 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GPNMBQ14956 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GPNMBQ14956 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GPNMBQ14956 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GPNMBQ14956 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GPNMBQ14956 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GPNMBQ14956 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
GPNMBQ14956 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GPNMBQ14956 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GPNMBQ14956 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GPNMBQ14956 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
GPNMBQ14956 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GPNMBQ14956 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GPNMBQ14956 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GPNMBQ14956 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GPNMBQ14956 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GPNMBQ14956 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GPNMBQ14956 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GPNMBQ14956 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GPNMBQ14956 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GPNMBQ14956 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GPNMBQ14956 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GPNMBQ14956 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GPNMBQ14956 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GPNMBQ14956 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GPNMBQ14956 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GPNMBQ14956 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GPNMBQ14956 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
GPNMBQ14956 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GPNMBQ14956 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GPNMBQ14956 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GPNMBQ14956 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms