Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
BECN1Q14457 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
BECN1Q14457 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
BECN1Q14457 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
BECN1Q14457 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
BECN1Q14457 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
BECN1Q14457 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
BECN1Q14457 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
BECN1Q14457 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
BECN1Q14457 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
BECN1Q14457 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
BECN1Q14457 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
BECN1Q14457 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
BECN1Q14457 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
BECN1Q14457 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
BECN1Q14457 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
BECN1Q14457 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
BECN1Q14457 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
BECN1Q14457 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
BECN1Q14457 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
BECN1Q14457 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
BECN1Q14457 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
BECN1Q14457 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
BECN1Q14457 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
BECN1Q14457 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
BECN1Q14457 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
BECN1Q14457 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
BECN1Q14457 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
BECN1Q14457 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
BECN1Q14457 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
BECN1Q14457 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
BECN1Q14457 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
BECN1Q14457 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
BECN1Q14457 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
BECN1Q14457 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
BECN1Q14457 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
BECN1Q14457 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
BECN1Q14457 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
BECN1Q14457 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
BECN1Q14457 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
BECN1Q14457 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
BECN1Q14457 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
BECN1Q14457 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
BECN1Q14457 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
BECN1Q14457 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
BECN1Q14457 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
BECN1Q14457 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
BECN1Q14457 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
BECN1Q14457 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
BECN1Q14457 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
BECN1Q14457 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
BECN1Q14457 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
BECN1Q14457 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
BECN1Q14457 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
BECN1Q14457 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
BECN1Q14457 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
BECN1Q14457 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
BECN1Q14457 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
BECN1Q14457 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
BECN1Q14457 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
BECN1Q14457 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
BECN1Q14457 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
BECN1Q14457 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
BECN1Q14457 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
BECN1Q14457 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
BECN1Q14457 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
BECN1Q14457 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
BECN1Q14457 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
BECN1Q14457 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
BECN1Q14457 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
BECN1Q14457 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
BECN1Q14457 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
BECN1Q14457 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
BECN1Q14457 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
BECN1Q14457 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
BECN1Q14457 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
BECN1Q14457 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
BECN1Q14457 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
BECN1Q14457 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
BECN1Q14457 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
BECN1Q14457 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
BECN1Q14457 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
BECN1Q14457 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
BECN1Q14457 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
BECN1Q14457 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
BECN1Q14457 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
BECN1Q14457 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
BECN1Q14457 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
BECN1Q14457 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
BECN1Q14457 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
BECN1Q14457 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
BECN1Q14457 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
BECN1Q14457 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
BECN1Q14457 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
BECN1Q14457 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
BECN1Q14457 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
BECN1Q14457 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
BECN1Q14457 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
BECN1Q14457 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
BECN1Q14457 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
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