Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM25Q14258 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM25Q14258 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM25Q14258 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM25Q14258 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM25Q14258 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM25Q14258 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM25Q14258 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM25Q14258 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM25Q14258 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM25Q14258 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM25Q14258 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM25Q14258 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM25Q14258 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM25Q14258 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM25Q14258 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM25Q14258 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM25Q14258 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM25Q14258 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM25Q14258 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM25Q14258 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM25Q14258 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM25Q14258 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM25Q14258 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM25Q14258 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM25Q14258 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM25Q14258 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TRIM25Q14258 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM25Q14258 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM25Q14258 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM25Q14258 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM25Q14258 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM25Q14258 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM25Q14258 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM25Q14258 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM25Q14258 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM25Q14258 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM25Q14258 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM25Q14258 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM25Q14258 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM25Q14258 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM25Q14258 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM25Q14258 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM25Q14258 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM25Q14258 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM25Q14258 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM25Q14258 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM25Q14258 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM25Q14258 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM25Q14258 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM25Q14258 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM25Q14258 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRIM25Q14258 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRIM25Q14258 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM25Q14258 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM25Q14258 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM25Q14258 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM25Q14258 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM25Q14258 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM25Q14258 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM25Q14258 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM25Q14258 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM25Q14258 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM25Q14258 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM25Q14258 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM25Q14258 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM25Q14258 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM25Q14258 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM25Q14258 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM25Q14258 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM25Q14258 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM25Q14258 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM25Q14258 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM25Q14258 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM25Q14258 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM25Q14258 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM25Q14258 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM25Q14258 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM25Q14258 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM25Q14258 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM25Q14258 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM25Q14258 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM25Q14258 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM25Q14258 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM25Q14258 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM25Q14258 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM25Q14258 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM25Q14258 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM25Q14258 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM25Q14258 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM25Q14258 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM25Q14258 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM25Q14258 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM25Q14258 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM25Q14258 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM25Q14258 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM25Q14258 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM25Q14258 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM25Q14258 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM25Q14258 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
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