Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF2H3Q13889 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF2H3Q13889 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF2H3Q13889 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF2H3Q13889 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF2H3Q13889 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF2H3Q13889 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF2H3Q13889 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF2H3Q13889 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTF2H3Q13889 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTF2H3Q13889 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF2H3Q13889 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF2H3Q13889 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF2H3Q13889 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF2H3Q13889 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF2H3Q13889 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF2H3Q13889 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF2H3Q13889 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF2H3Q13889 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF2H3Q13889 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF2H3Q13889 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF2H3Q13889 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF2H3Q13889 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF2H3Q13889 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF2H3Q13889 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF2H3Q13889 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF2H3Q13889 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF2H3Q13889 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF2H3Q13889 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF2H3Q13889 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF2H3Q13889 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GTF2H3Q13889 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GTF2H3Q13889 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF2H3Q13889 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF2H3Q13889 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF2H3Q13889 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF2H3Q13889 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF2H3Q13889 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF2H3Q13889 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF2H3Q13889 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF2H3Q13889 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF2H3Q13889 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF2H3Q13889 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF2H3Q13889 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF2H3Q13889 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF2H3Q13889 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF2H3Q13889 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF2H3Q13889 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF2H3Q13889 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF2H3Q13889 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF2H3Q13889 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF2H3Q13889 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF2H3Q13889 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF2H3Q13889 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF2H3Q13889 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF2H3Q13889 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF2H3Q13889 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF2H3Q13889 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF2H3Q13889 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF2H3Q13889 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF2H3Q13889 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF2H3Q13889 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF2H3Q13889 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF2H3Q13889 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF2H3Q13889 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF2H3Q13889 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF2H3Q13889 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF2H3Q13889 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF2H3Q13889 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF2H3Q13889 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF2H3Q13889 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF2H3Q13889 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF2H3Q13889 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF2H3Q13889 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF2H3Q13889 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF2H3Q13889 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF2H3Q13889 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF2H3Q13889 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF2H3Q13889 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF2H3Q13889 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF2H3Q13889 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF2H3Q13889 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF2H3Q13889 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF2H3Q13889 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF2H3Q13889 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF2H3Q13889 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF2H3Q13889 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF2H3Q13889 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF2H3Q13889 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GTF2H3Q13889 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GTF2H3Q13889 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GTF2H3Q13889 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GTF2H3Q13889 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GTF2H3Q13889 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2H3Q13889 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2H3Q13889 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF2H3Q13889 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF2H3Q13889 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF2H3Q13889 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF2H3Q13889 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms