Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HTR4Q13639 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HTR4Q13639 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HTR4Q13639 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
HTR4Q13639 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HTR4Q13639 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HTR4Q13639 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
HTR4Q13639 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
HTR4Q13639 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HTR4Q13639 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HTR4Q13639 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HTR4Q13639 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HTR4Q13639 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
HTR4Q13639 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HTR4Q13639 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HTR4Q13639 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HTR4Q13639 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HTR4Q13639 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HTR4Q13639 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HTR4Q13639 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HTR4Q13639 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HTR4Q13639 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HTR4Q13639 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HTR4Q13639 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HTR4Q13639 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HTR4Q13639 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HTR4Q13639 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HTR4Q13639 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HTR4Q13639 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HTR4Q13639 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
HTR4Q13639 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HTR4Q13639 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HTR4Q13639 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HTR4Q13639 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HTR4Q13639 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HTR4Q13639 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HTR4Q13639 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HTR4Q13639 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HTR4Q13639 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HTR4Q13639 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HTR4Q13639 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HTR4Q13639 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HTR4Q13639 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HTR4Q13639 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HTR4Q13639 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HTR4Q13639 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HTR4Q13639 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HTR4Q13639 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HTR4Q13639 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HTR4Q13639 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HTR4Q13639 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HTR4Q13639 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
HTR4Q13639 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
HTR4Q13639 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HTR4Q13639 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HTR4Q13639 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HTR4Q13639 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HTR4Q13639 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HTR4Q13639 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HTR4Q13639 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HTR4Q13639 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.8
HTR4Q13639 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
HTR4Q13639 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HTR4Q13639 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
HTR4Q13639 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HTR4Q13639 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HTR4Q13639 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HTR4Q13639 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HTR4Q13639 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HTR4Q13639 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HTR4Q13639 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HTR4Q13639 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HTR4Q13639 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HTR4Q13639 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HTR4Q13639 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HTR4Q13639 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HTR4Q13639 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HTR4Q13639 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HTR4Q13639 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HTR4Q13639 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HTR4Q13639 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HTR4Q13639 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HTR4Q13639 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HTR4Q13639 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HTR4Q13639 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HTR4Q13639 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HTR4Q13639 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HTR4Q13639 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HTR4Q13639 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
HTR4Q13639 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HTR4Q13639 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HTR4Q13639 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HTR4Q13639 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HTR4Q13639 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
HTR4Q13639 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HTR4Q13639 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HTR4Q13639 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HTR4Q13639 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HTR4Q13639 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
HTR4Q13639 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms