Protein–RNA interactions for Protein: Q13613

MTMR1, Myotubularin-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR1Q13613 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MTMR1Q13613 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MTMR1Q13613 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MTMR1Q13613 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MTMR1Q13613 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MTMR1Q13613 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MTMR1Q13613 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
MTMR1Q13613 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
MTMR1Q13613 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
MTMR1Q13613 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
MTMR1Q13613 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
MTMR1Q13613 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
MTMR1Q13613 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MTMR1Q13613 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MTMR1Q13613 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MTMR1Q13613 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MTMR1Q13613 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MTMR1Q13613 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MTMR1Q13613 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MTMR1Q13613 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MTMR1Q13613 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MTMR1Q13613 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MTMR1Q13613 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MTMR1Q13613 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
MTMR1Q13613 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MTMR1Q13613 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MTMR1Q13613 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MTMR1Q13613 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
MTMR1Q13613 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MTMR1Q13613 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MTMR1Q13613 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MTMR1Q13613 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MTMR1Q13613 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
MTMR1Q13613 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MTMR1Q13613 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MTMR1Q13613 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MTMR1Q13613 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MTMR1Q13613 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MTMR1Q13613 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MTMR1Q13613 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MTMR1Q13613 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MTMR1Q13613 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MTMR1Q13613 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MTMR1Q13613 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MTMR1Q13613 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
MTMR1Q13613 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MTMR1Q13613 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MTMR1Q13613 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MTMR1Q13613 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MTMR1Q13613 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MTMR1Q13613 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MTMR1Q13613 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MTMR1Q13613 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MTMR1Q13613 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
MTMR1Q13613 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
MTMR1Q13613 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
MTMR1Q13613 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
MTMR1Q13613 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MTMR1Q13613 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MTMR1Q13613 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MTMR1Q13613 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MTMR1Q13613 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MTMR1Q13613 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MTMR1Q13613 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MTMR1Q13613 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MTMR1Q13613 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
MTMR1Q13613 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MTMR1Q13613 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MTMR1Q13613 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MTMR1Q13613 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MTMR1Q13613 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MTMR1Q13613 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MTMR1Q13613 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MTMR1Q13613 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MTMR1Q13613 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MTMR1Q13613 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MTMR1Q13613 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MTMR1Q13613 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MTMR1Q13613 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MTMR1Q13613 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MTMR1Q13613 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MTMR1Q13613 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MTMR1Q13613 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MTMR1Q13613 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MTMR1Q13613 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MTMR1Q13613 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
MTMR1Q13613 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MTMR1Q13613 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MTMR1Q13613 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MTMR1Q13613 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MTMR1Q13613 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MTMR1Q13613 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MTMR1Q13613 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MTMR1Q13613 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MTMR1Q13613 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MTMR1Q13613 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MTMR1Q13613 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
MTMR1Q13613 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MTMR1Q13613 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MTMR1Q13613 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 522.6 ms