Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRR1Q13601 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRR1Q13601 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRR1Q13601 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRR1Q13601 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRR1Q13601 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRR1Q13601 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRR1Q13601 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRR1Q13601 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRR1Q13601 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRR1Q13601 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRR1Q13601 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRR1Q13601 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRR1Q13601 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRR1Q13601 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KRR1Q13601 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KRR1Q13601 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KRR1Q13601 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRR1Q13601 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRR1Q13601 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRR1Q13601 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRR1Q13601 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KRR1Q13601 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRR1Q13601 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRR1Q13601 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRR1Q13601 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRR1Q13601 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRR1Q13601 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRR1Q13601 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRR1Q13601 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
KRR1Q13601 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRR1Q13601 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRR1Q13601 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRR1Q13601 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRR1Q13601 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRR1Q13601 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRR1Q13601 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRR1Q13601 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRR1Q13601 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRR1Q13601 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRR1Q13601 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRR1Q13601 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRR1Q13601 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRR1Q13601 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRR1Q13601 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRR1Q13601 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRR1Q13601 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRR1Q13601 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRR1Q13601 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRR1Q13601 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRR1Q13601 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRR1Q13601 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KRR1Q13601 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRR1Q13601 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRR1Q13601 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRR1Q13601 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRR1Q13601 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRR1Q13601 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRR1Q13601 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRR1Q13601 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRR1Q13601 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRR1Q13601 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRR1Q13601 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRR1Q13601 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRR1Q13601 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRR1Q13601 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRR1Q13601 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRR1Q13601 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRR1Q13601 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRR1Q13601 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRR1Q13601 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRR1Q13601 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRR1Q13601 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRR1Q13601 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRR1Q13601 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRR1Q13601 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRR1Q13601 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRR1Q13601 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRR1Q13601 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRR1Q13601 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRR1Q13601 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRR1Q13601 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRR1Q13601 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRR1Q13601 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRR1Q13601 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRR1Q13601 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRR1Q13601 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRR1Q13601 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRR1Q13601 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
KRR1Q13601 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRR1Q13601 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRR1Q13601 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRR1Q13601 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRR1Q13601 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRR1Q13601 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRR1Q13601 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KRR1Q13601 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KRR1Q13601 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KRR1Q13601 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KRR1Q13601 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
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