Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRR1Q13601 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRR1Q13601 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRR1Q13601 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRR1Q13601 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRR1Q13601 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRR1Q13601 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRR1Q13601 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRR1Q13601 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRR1Q13601 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRR1Q13601 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRR1Q13601 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRR1Q13601 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRR1Q13601 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRR1Q13601 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KRR1Q13601 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KRR1Q13601 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KRR1Q13601 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRR1Q13601 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRR1Q13601 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRR1Q13601 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRR1Q13601 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KRR1Q13601 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRR1Q13601 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRR1Q13601 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRR1Q13601 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRR1Q13601 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRR1Q13601 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRR1Q13601 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRR1Q13601 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
KRR1Q13601 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRR1Q13601 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRR1Q13601 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRR1Q13601 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRR1Q13601 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRR1Q13601 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRR1Q13601 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRR1Q13601 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRR1Q13601 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRR1Q13601 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRR1Q13601 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRR1Q13601 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRR1Q13601 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRR1Q13601 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRR1Q13601 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRR1Q13601 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRR1Q13601 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRR1Q13601 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRR1Q13601 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRR1Q13601 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRR1Q13601 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRR1Q13601 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KRR1Q13601 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRR1Q13601 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRR1Q13601 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRR1Q13601 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRR1Q13601 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRR1Q13601 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRR1Q13601 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRR1Q13601 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRR1Q13601 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRR1Q13601 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRR1Q13601 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRR1Q13601 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRR1Q13601 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRR1Q13601 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRR1Q13601 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRR1Q13601 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRR1Q13601 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRR1Q13601 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRR1Q13601 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRR1Q13601 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRR1Q13601 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRR1Q13601 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRR1Q13601 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRR1Q13601 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRR1Q13601 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRR1Q13601 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRR1Q13601 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRR1Q13601 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRR1Q13601 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRR1Q13601 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRR1Q13601 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRR1Q13601 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRR1Q13601 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRR1Q13601 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRR1Q13601 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRR1Q13601 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRR1Q13601 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
KRR1Q13601 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRR1Q13601 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRR1Q13601 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRR1Q13601 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRR1Q13601 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRR1Q13601 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRR1Q13601 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KRR1Q13601 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KRR1Q13601 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KRR1Q13601 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KRR1Q13601 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
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