Protein–RNA interactions for Protein: Q13595

TRA2A, Transformer-2 protein homolog alpha, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRA2AQ13595 DYNC1I2-216ENST00000443458 589 ntTSL 511.5□□□□□ -0.573e-6■■■■■ 31
TRA2AQ13595 DYNC1I2-221ENST00000471482 581 ntTSL 210.81□□□□□ -0.683e-6■■■■■ 31
TRA2AQ13595 DYNC1I2-209ENST00000412370 577 ntTSL 43.3□□□□□ -1.883e-6■■■■■ 31
TRA2AQ13595 PPP1R12A-221ENST00000553081 1101 ntTSL 52.57□□□□□ -21e-8■■■■■ 30.7
TRA2AQ13595 PPP1R12A-212ENST00000550007 443 ntTSL 22.23□□□□□ -2.051e-8■■■■■ 30.7
TRA2AQ13595 PDXDC1-213ENST00000566426 283 ntTSL 520.3■□□□□ 0.845e-13■■■■■ 30.7
TRA2AQ13595 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.262e-8■■■■■ 30.7
TRA2AQ13595 CHAF1A-202ENST00000585371 884 ntTSL 512.86□□□□□ -0.352e-8■■■■■ 30.7
TRA2AQ13595 CHAF1A-206ENST00000587739 875 ntTSL 59.43□□□□□ -0.92e-8■■■■■ 30.7
TRA2AQ13595 HUWE1-202ENST00000262854 14739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.971e-7■■■■■ 30.7
TRA2AQ13595 HUWE1-203ENST00000342160 14796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.471e-7■■■■■ 30.7
TRA2AQ13595 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.621e-7■■■■■ 30.7
TRA2AQ13595 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.471e-9■■■■■ 30.7
TRA2AQ13595 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.611e-9■■■■■ 30.7
TRA2AQ13595 ING3-203ENST00000427726 1718 ntTSL 1 (best)4.23□□□□□ -1.731e-9■■■■■ 30.7
TRA2AQ13595 RPL17-214ENST00000582588 401 ntTSL 22.82□□□□□ -1.966e-36■■■■■ 30.7
TRA2AQ13595 RBM6-209ENST00000441115 1876 ntTSL 217.1■□□□□ 0.334e-8■■■■■ 30.6
TRA2AQ13595 SPAG9-215ENST00000513746 822 ntTSL 516.41■□□□□ 0.225e-7■■■■■ 30.5
TRA2AQ13595 SPAG9-217ENST00000513906 750 ntTSL 59.1□□□□□ -0.955e-7■■■■■ 30.5
TRA2AQ13595 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.874e-7■■■■■ 30.5
TRA2AQ13595 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.014e-7■■■■■ 30.5
TRA2AQ13595 ZFP91-CNTF-202ENST00000422974 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 510.57□□□□□ -0.724e-7■■■■■ 30.5
TRA2AQ13595 HNRNPR-205ENST00000463552 837 ntTSL 46.48□□□□□ -1.372e-7■■■■■ 30.4
TRA2AQ13595 NCOR1-205ENST00000395857 9501 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.421e-8■■■■■ 30.4
TRA2AQ13595 NCOR1-204ENST00000395851 7950 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.421e-8■■■■■ 30.4
TRA2AQ13595 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.481e-8■■■■■ 30.4
TRA2AQ13595 NCOR1-201ENST00000268712 10720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.51e-8■■■■■ 30.4
TRA2AQ13595 HECTD1-208ENST00000554882 3748 ntTSL 54.87□□□□□ -1.636e-7■■■■■ 30.4
TRA2AQ13595 HECTD1-210ENST00000555843 4281 ntTSL 24.47□□□□□ -1.696e-7■■■■■ 30.4
TRA2AQ13595 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.724e-8■■■■■ 30.3
TRA2AQ13595 RBCK1-205ENST00000400245 1024 ntTSL 318.01■□□□□ 0.474e-8■■■■■ 30.3
TRA2AQ13595 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.344e-8■■■■■ 30.3
TRA2AQ13595 RBCK1-210ENST00000441733 961 ntTSL 517.15■□□□□ 0.344e-8■■■■■ 30.3
TRA2AQ13595 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.084e-8■■■■■ 30.3
TRA2AQ13595 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.054e-8■■■■■ 30.3
TRA2AQ13595 RBCK1-211ENST00000465226 372 ntTSL 315.07■□□□□ 04e-8■■■■■ 30.3
TRA2AQ13595 CTSL-206ENST00000495822 988 ntTSL 1 (best)14.83□□□□□ -0.044e-8■■■■■ 30.3
TRA2AQ13595 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.044e-8■■■■■ 30.3
TRA2AQ13595 RBCK1-209ENST00000415942 2613 ntTSL 514.67□□□□□ -0.064e-8■■■■■ 30.3
TRA2AQ13595 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.134e-8■■■■■ 30.3
TRA2AQ13595 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.24e-8■■■■■ 30.3
TRA2AQ13595 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.24e-8■■■■■ 30.3
TRA2AQ13595 CTSL-204ENST00000375894 975 ntTSL 313.63□□□□□ -0.234e-8■■■■■ 30.3
TRA2AQ13595 RBCK1-204ENST00000382214 2752 ntTSL 1 (best)13.6□□□□□ -0.234e-8■■■■■ 30.3
TRA2AQ13595 CTSL-205ENST00000482054 908 ntTSL 212.87□□□□□ -0.354e-8■■■■■ 30.3
TRA2AQ13595 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.384e-8■■■■■ 30.3
TRA2AQ13595 RBCK1-207ENST00000411647 593 ntTSL 39.73□□□□□ -0.854e-8■■■■■ 30.3
TRA2AQ13595 NAP1L4-209ENST00000492594 570 ntTSL 317.6■□□□□ 0.413e-7■■■■■ 30.3
TRA2AQ13595 NAP1L4-211ENST00000526023 477 ntTSL 517.29■□□□□ 0.363e-7■■■■■ 30.3
TRA2AQ13595 NAP1L4-207ENST00000469805 2294 ntTSL 315.04■□□□□ -03e-7■■■■■ 30.3
TRA2AQ13595 TAF1D-220ENST00000534770 737 ntTSL 314.98□□□□□ -0.012e-8■■■■■ 30.2
TRA2AQ13595 EZH2-207ENST00000483012 1491 ntTSL 222.59■■□□□ 1.212e-9■■■■■ 30.1
TRA2AQ13595 DNAJC2-209ENST00000475090 480 ntTSL 51.6□□□□□ -2.152e-9■■■■■ 30.1
TRA2AQ13595 LUCAT1-201ENST00000511918 828 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.372e-6■■■■■ 30.1
TRA2AQ13595 LUCAT1-202ENST00000513492 433 ntTSL 55.05□□□□□ -1.62e-6■■■■■ 30.1
TRA2AQ13595 RBM6-202ENST00000419610 2128 ntTSL 218.11■□□□□ 0.495e-7■■■■■ 30
TRA2AQ13595 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.365e-7■■■■■ 30
TRA2AQ13595 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.065e-7■■■■■ 30
TRA2AQ13595 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.445e-7■■■■■ 30
TRA2AQ13595 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.475e-7■■■■■ 30
TRA2AQ13595 RBM6-213ENST00000454079 4324 ntTSL 210.7□□□□□ -0.75e-7■■■■■ 30
TRA2AQ13595 RBM6-207ENST00000434592 2342 ntTSL 26.37□□□□□ -1.395e-7■■■■■ 30
TRA2AQ13595 HEMGN-201ENST00000259456 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.161e-10■■■■■ 30
TRA2AQ13595 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.641e-10■■■■■ 30
TRA2AQ13595 DNAJC2-206ENST00000454277 854 ntTSL 513.27□□□□□ -0.291e-6■■■■■ 29.9
TRA2AQ13595 CCDC66-203ENST00000394672 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.211e-8■■■■■ 29.9
TRA2AQ13595 CCDC66-220ENST00000484623 852 ntTSL 56.31□□□□□ -1.41e-8■■■■■ 29.9
TRA2AQ13595 CCDC66-204ENST00000422222 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 54.89□□□□□ -1.631e-8■■■■■ 29.9
TRA2AQ13595 CCDC66-211ENST00000468108 567 ntTSL 44.77□□□□□ -1.651e-8■■■■■ 29.9
TRA2AQ13595 CCDC66-202ENST00000341455 3042 ntTSL 1 (best)3.41□□□□□ -1.861e-8■■■■■ 29.9
TRA2AQ13595 CCDC66-213ENST00000471681 3120 ntTSL 53.39□□□□□ -1.871e-8■■■■■ 29.9
TRA2AQ13595 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.981e-8■■■■■ 29.9
TRA2AQ13595 NAP1L1-217ENST00000549988 544 ntTSL 311.98□□□□□ -0.492e-25■■■■■ 29.8
TRA2AQ13595 PCM1-204ENST00000517730 2536 ntTSL 1 (best)12.69□□□□□ -0.383e-10■■■■■ 29.8
TRA2AQ13595 HSPA8-208ENST00000526686 740 ntTSL 1 (best)3.57□□□□□ -1.841e-32■■■■■ 29.8
TRA2AQ13595 DNAJC2-211ENST00000492497 2167 ntTSL 29.83□□□□□ -0.843e-9■■■■■ 29.8
TRA2AQ13595 NFATC2IP-202ENST00000562977 638 ntTSL 426.33■■□□□ 1.818e-7■■■■■ 29.7
TRA2AQ13595 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.268e-7■■■■■ 29.7
TRA2AQ13595 HNF4A-203ENST00000372920 3340 ntTSL 1 (best)15.23■□□□□ 0.038e-7■■■■■ 29.7
TRA2AQ13595 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.038e-7■■■■■ 29.7
TRA2AQ13595 SRSF7-203ENST00000415527 1135 ntTSL 514.42□□□□□ -0.18e-7■■■■■ 29.7
TRA2AQ13595 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.118e-7■■■■■ 29.7
TRA2AQ13595 CCDC144NL-AS1-205ENST00000439794 481 ntTSL 314.39□□□□□ -0.118e-7■■■■■ 29.7
TRA2AQ13595 RSRC2-212ENST00000527399 1041 ntTSL 514.28□□□□□ -0.123e-9■■■■■ 29.7
TRA2AQ13595 NFATC2IP-207ENST00000568998 720 ntTSL 312.86□□□□□ -0.358e-7■■■■■ 29.7
TRA2AQ13595 DNMT1-205ENST00000585920 529 ntTSL 312.67□□□□□ -0.388e-7■■■■■ 29.7
TRA2AQ13595 HNF4A-206ENST00000457232 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.398e-7■■■■■ 29.7
TRA2AQ13595 RSRC2-204ENST00000433877 1956 ntTSL 212.16□□□□□ -0.468e-8■■■■■ 29.7
TRA2AQ13595 HNF4A-204ENST00000415691 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.488e-7■■■■■ 29.7
TRA2AQ13595 DNMT1-201ENST00000340748 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.513e-8■■■■■ 29.7
TRA2AQ13595 DNMT1-228ENST00000592705 5215 ntTSL 1 (best)11.72□□□□□ -0.533e-8■■■■■ 29.7
TRA2AQ13595 RSRC2-202ENST00000344591 936 ntTSL 211.54□□□□□ -0.561e-8■■■■■ 29.7
TRA2AQ13595 RSRC2-207ENST00000525335 1146 ntTSL 511.53□□□□□ -0.561e-8■■■■■ 29.7
TRA2AQ13595 DNMT1-202ENST00000359526 5206 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.63e-8■■■■■ 29.7
TRA2AQ13595 DNMT1-203ENST00000540357 4916 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.623e-8■■■■■ 29.7
TRA2AQ13595 LINC01021-202ENST00000505775 946 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.643e-6■■■■■ 29.7
TRA2AQ13595 CCDC144NL-AS1-215ENST00000582324 756 ntTSL 311.01□□□□□ -0.658e-7■■■■■ 29.7
TRA2AQ13595 RSRC2-220ENST00000532695 2001 ntTSL 210.94□□□□□ -0.668e-8■■■■■ 29.7
TRA2AQ13595 CCDC144NL-AS1-218ENST00000583962 3352 ntTSL 1 (best)10.71□□□□□ -0.698e-7■■■■■ 29.7
TRA2AQ13595 LINC01021-203ENST00000510165 1106 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.693e-6■■■■■ 29.7
Retrieved 100 of 7,337 protein–RNA pairs in 34.5 ms