Protein–RNA interactions for Protein: Q13405

MRPL49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL49Q13405 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MRPL49Q13405 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MRPL49Q13405 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MRPL49Q13405 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MRPL49Q13405 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MRPL49Q13405 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MRPL49Q13405 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MRPL49Q13405 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MRPL49Q13405 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MRPL49Q13405 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MRPL49Q13405 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MRPL49Q13405 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MRPL49Q13405 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MRPL49Q13405 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MRPL49Q13405 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MRPL49Q13405 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MRPL49Q13405 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MRPL49Q13405 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MRPL49Q13405 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MRPL49Q13405 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MRPL49Q13405 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MRPL49Q13405 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MRPL49Q13405 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MRPL49Q13405 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRPL49Q13405 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRPL49Q13405 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRPL49Q13405 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRPL49Q13405 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRPL49Q13405 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRPL49Q13405 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRPL49Q13405 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRPL49Q13405 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRPL49Q13405 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MRPL49Q13405 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MRPL49Q13405 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MRPL49Q13405 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MRPL49Q13405 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MRPL49Q13405 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MRPL49Q13405 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
MRPL49Q13405 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MRPL49Q13405 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MRPL49Q13405 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MRPL49Q13405 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MRPL49Q13405 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MRPL49Q13405 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MRPL49Q13405 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MRPL49Q13405 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MRPL49Q13405 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MRPL49Q13405 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MRPL49Q13405 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MRPL49Q13405 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MRPL49Q13405 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MRPL49Q13405 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MRPL49Q13405 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MRPL49Q13405 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRPL49Q13405 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MRPL49Q13405 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRPL49Q13405 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRPL49Q13405 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MRPL49Q13405 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRPL49Q13405 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRPL49Q13405 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRPL49Q13405 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MRPL49Q13405 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MRPL49Q13405 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MRPL49Q13405 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MRPL49Q13405 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MRPL49Q13405 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MRPL49Q13405 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MRPL49Q13405 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MRPL49Q13405 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MRPL49Q13405 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MRPL49Q13405 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MRPL49Q13405 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRPL49Q13405 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MRPL49Q13405 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRPL49Q13405 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRPL49Q13405 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRPL49Q13405 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRPL49Q13405 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MRPL49Q13405 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRPL49Q13405 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MRPL49Q13405 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MRPL49Q13405 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
MRPL49Q13405 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MRPL49Q13405 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MRPL49Q13405 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MRPL49Q13405 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MRPL49Q13405 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MRPL49Q13405 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRPL49Q13405 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRPL49Q13405 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRPL49Q13405 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRPL49Q13405 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRPL49Q13405 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRPL49Q13405 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MRPL49Q13405 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRPL49Q13405 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRPL49Q13405 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MRPL49Q13405 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
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