Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRSF6Q13247 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRSF6Q13247 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRSF6Q13247 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRSF6Q13247 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRSF6Q13247 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRSF6Q13247 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRSF6Q13247 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRSF6Q13247 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRSF6Q13247 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRSF6Q13247 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRSF6Q13247 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRSF6Q13247 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRSF6Q13247 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRSF6Q13247 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRSF6Q13247 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRSF6Q13247 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SRSF6Q13247 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRSF6Q13247 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRSF6Q13247 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRSF6Q13247 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRSF6Q13247 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRSF6Q13247 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRSF6Q13247 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRSF6Q13247 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRSF6Q13247 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRSF6Q13247 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRSF6Q13247 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRSF6Q13247 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRSF6Q13247 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRSF6Q13247 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SRSF6Q13247 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRSF6Q13247 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRSF6Q13247 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRSF6Q13247 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRSF6Q13247 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRSF6Q13247 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRSF6Q13247 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRSF6Q13247 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRSF6Q13247 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRSF6Q13247 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRSF6Q13247 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRSF6Q13247 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRSF6Q13247 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRSF6Q13247 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRSF6Q13247 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRSF6Q13247 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRSF6Q13247 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRSF6Q13247 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SRSF6Q13247 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRSF6Q13247 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRSF6Q13247 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRSF6Q13247 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRSF6Q13247 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRSF6Q13247 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRSF6Q13247 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRSF6Q13247 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SRSF6Q13247 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SRSF6Q13247 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SRSF6Q13247 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SRSF6Q13247 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRSF6Q13247 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRSF6Q13247 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SRSF6Q13247 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRSF6Q13247 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRSF6Q13247 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRSF6Q13247 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SRSF6Q13247 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SRSF6Q13247 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SRSF6Q13247 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SRSF6Q13247 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SRSF6Q13247 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SRSF6Q13247 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SRSF6Q13247 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SRSF6Q13247 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SRSF6Q13247 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SRSF6Q13247 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SRSF6Q13247 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SRSF6Q13247 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SRSF6Q13247 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SRSF6Q13247 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SRSF6Q13247 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SRSF6Q13247 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SRSF6Q13247 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SRSF6Q13247 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SRSF6Q13247 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SRSF6Q13247 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SRSF6Q13247 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SRSF6Q13247 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SRSF6Q13247 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SRSF6Q13247 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SRSF6Q13247 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SRSF6Q13247 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SRSF6Q13247 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SRSF6Q13247 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SRSF6Q13247 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SRSF6Q13247 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SRSF6Q13247 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SRSF6Q13247 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRSF6Q13247 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
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