Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
EFEMP1Q12805 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EFEMP1Q12805 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EFEMP1Q12805 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EFEMP1Q12805 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EFEMP1Q12805 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EFEMP1Q12805 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EFEMP1Q12805 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EFEMP1Q12805 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EFEMP1Q12805 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
EFEMP1Q12805 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EFEMP1Q12805 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EFEMP1Q12805 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
EFEMP1Q12805 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EFEMP1Q12805 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
EFEMP1Q12805 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
EFEMP1Q12805 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EFEMP1Q12805 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EFEMP1Q12805 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EFEMP1Q12805 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EFEMP1Q12805 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EFEMP1Q12805 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EFEMP1Q12805 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EFEMP1Q12805 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EFEMP1Q12805 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EFEMP1Q12805 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
EFEMP1Q12805 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EFEMP1Q12805 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EFEMP1Q12805 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EFEMP1Q12805 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EFEMP1Q12805 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EFEMP1Q12805 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
EFEMP1Q12805 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EFEMP1Q12805 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EFEMP1Q12805 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
EFEMP1Q12805 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EFEMP1Q12805 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
EFEMP1Q12805 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EFEMP1Q12805 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
EFEMP1Q12805 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EFEMP1Q12805 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EFEMP1Q12805 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EFEMP1Q12805 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EFEMP1Q12805 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EFEMP1Q12805 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EFEMP1Q12805 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EFEMP1Q12805 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EFEMP1Q12805 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EFEMP1Q12805 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EFEMP1Q12805 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EFEMP1Q12805 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EFEMP1Q12805 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EFEMP1Q12805 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EFEMP1Q12805 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EFEMP1Q12805 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EFEMP1Q12805 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EFEMP1Q12805 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EFEMP1Q12805 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EFEMP1Q12805 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EFEMP1Q12805 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EFEMP1Q12805 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EFEMP1Q12805 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EFEMP1Q12805 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EFEMP1Q12805 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EFEMP1Q12805 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EFEMP1Q12805 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EFEMP1Q12805 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EFEMP1Q12805 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EFEMP1Q12805 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EFEMP1Q12805 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EFEMP1Q12805 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EFEMP1Q12805 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EFEMP1Q12805 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EFEMP1Q12805 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
EFEMP1Q12805 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
EFEMP1Q12805 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
EFEMP1Q12805 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EFEMP1Q12805 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EFEMP1Q12805 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
EFEMP1Q12805 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EFEMP1Q12805 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
EFEMP1Q12805 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EFEMP1Q12805 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EFEMP1Q12805 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
EFEMP1Q12805 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
EFEMP1Q12805 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
EFEMP1Q12805 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EFEMP1Q12805 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EFEMP1Q12805 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EFEMP1Q12805 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EFEMP1Q12805 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EFEMP1Q12805 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EFEMP1Q12805 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EFEMP1Q12805 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EFEMP1Q12805 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
EFEMP1Q12805 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EFEMP1Q12805 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
EFEMP1Q12805 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EFEMP1Q12805 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EFEMP1Q12805 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
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