Protein–RNA interactions for Protein: Q12241

VAM3, Syntaxin VAM3, yeastyeast

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VAM3Q12241 ERO1YML130C 1692 nt6.78□□□□□ -1.32
VAM3Q12241 SER2YGR208W 930 nt6.78□□□□□ -1.32
VAM3Q12241 RCF1YML030W 480 nt6.78□□□□□ -1.32
VAM3Q12241 MRP7YNL005C 1116 nt6.78□□□□□ -1.32
VAM3Q12241 IDP3YNL009W 1263 nt6.78□□□□□ -1.32
VAM3Q12241 OLA1YBR025C 1185 nt6.78□□□□□ -1.32
VAM3Q12241 NMD5YJR132W 3147 nt6.78□□□□□ -1.32
VAM3Q12241 MET13YGL125W 1803 nt6.78□□□□□ -1.32
VAM3Q12241 DAL7YIR031C 1665 nt6.77□□□□□ -1.32
VAM3Q12241 RRT6YGL146C 936 nt6.77□□□□□ -1.33
VAM3Q12241 FAF1YIL019W 1041 nt6.77□□□□□ -1.33
VAM3Q12241 PUP1YOR157C 786 nt6.76□□□□□ -1.33
VAM3Q12241 ITR1YDR497C 1755 nt6.76□□□□□ -1.33
VAM3Q12241 HTS1YPR033C 1641 nt6.76□□□□□ -1.33
VAM3Q12241 PRC1YMR297W 1599 nt6.75□□□□□ -1.33
VAM3Q12241 YNL040WYNL040W 1371 nt6.75□□□□□ -1.33
VAM3Q12241 ASN2YGR124W 1719 nt6.75□□□□□ -1.33
VAM3Q12241 YOS9YDR057W 1629 nt6.75□□□□□ -1.33
VAM3Q12241 CIR2YOR356W 1896 nt6.75□□□□□ -1.33
VAM3Q12241 HXT9YJL219W 1704 nt6.73□□□□□ -1.33
VAM3Q12241 RSC9YML127W 1746 nt6.73□□□□□ -1.33
VAM3Q12241 SGF73YGL066W 1974 nt6.73□□□□□ -1.33
VAM3Q12241 SPE4YLR146C 903 nt6.73□□□□□ -1.33
VAM3Q12241 YER152CYER152C 1332 nt6.73□□□□□ -1.33
VAM3Q12241 YGR210CYGR210C 1236 nt6.72□□□□□ -1.33
VAM3Q12241 MET22YOL064C 1074 nt6.72□□□□□ -1.33
VAM3Q12241 ADE17YMR120C 1779 nt6.72□□□□□ -1.33
VAM3Q12241 ARO3YDR035W 1113 nt6.71□□□□□ -1.34
VAM3Q12241 RNA170RNA170 169 nt6.71□□□□□ -1.34
VAM3Q12241 ATO2YNR002C 849 nt6.71□□□□□ -1.34
VAM3Q12241 ALG7YBR243C 1347 nt6.71□□□□□ -1.34
VAM3Q12241 MAS2YHR024C 1449 nt6.7□□□□□ -1.34
VAM3Q12241 ATP10YLR393W 840 nt6.7□□□□□ -1.34
VAM3Q12241 YMR166CYMR166C 1107 nt6.7□□□□□ -1.34
VAM3Q12241 OCH1YGL038C 1443 nt6.69□□□□□ -1.34
VAM3Q12241 TOS2YGR221C 1869 nt6.69□□□□□ -1.34
VAM3Q12241 PDC6YGR087C 1692 nt6.69□□□□□ -1.34
VAM3Q12241 CHA1YCL064C 1083 nt6.69□□□□□ -1.34
VAM3Q12241 YCP4YCR004C 744 nt6.69□□□□□ -1.34
VAM3Q12241 SWM1YDR260C 513 nt6.69□□□□□ -1.34
VAM3Q12241 CKB1YGL019W 837 nt6.69□□□□□ -1.34
VAM3Q12241 SLG1YOR008C 1137 nt6.69□□□□□ -1.34
VAM3Q12241 YPL108WYPL108W 507 nt6.69□□□□□ -1.34
VAM3Q12241 SGV1YPR161C 1974 nt6.69□□□□□ -1.34
VAM3Q12241 PRP2YNR011C 2631 nt6.68□□□□□ -1.34
VAM3Q12241 ERG6YML008C 1152 nt6.68□□□□□ -1.34
VAM3Q12241 HSM3YBR272C 1443 nt6.67□□□□□ -1.34
VAM3Q12241 SAM50YNL026W 1455 nt6.67□□□□□ -1.34
VAM3Q12241 PMT1YDL095W 2454 nt6.67□□□□□ -1.34
VAM3Q12241 FCP1YMR277W 2199 nt6.67□□□□□ -1.34
VAM3Q12241 TGA1tA(UGC)A 73 nt6.67□□□□□ -1.34
VAM3Q12241 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt6.67□□□□□ -1.34
VAM3Q12241 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt6.67□□□□□ -1.34
VAM3Q12241 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt6.67□□□□□ -1.34
VAM3Q12241 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt6.67□□□□□ -1.34
VAM3Q12241 CAK1YFL029C 1107 nt6.67□□□□□ -1.34
VAM3Q12241 RHO1YPR165W 630 nt6.67□□□□□ -1.34
VAM3Q12241 AVL9YLR114C 2295 nt6.66□□□□□ -1.34
VAM3Q12241 PUP3YER094C 618 nt6.66□□□□□ -1.34
VAM3Q12241 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt6.66□□□□□ -1.34
VAM3Q12241 TES1YJR019C 1050 nt6.66□□□□□ -1.34
VAM3Q12241 RRT14YIL127C 621 nt6.65□□□□□ -1.34
VAM3Q12241 CDA1YLR307W 906 nt6.65□□□□□ -1.34
VAM3Q12241 YTH1YPR107C 627 nt6.65□□□□□ -1.34
VAM3Q12241 SNP1YIL061C 903 nt6.64□□□□□ -1.35
VAM3Q12241 ELP6YMR312W 822 nt6.64□□□□□ -1.35
VAM3Q12241 LSP1YPL004C 1026 nt6.64□□□□□ -1.35
VAM3Q12241 ERR3YMR323W 1314 nt6.64□□□□□ -1.35
VAM3Q12241 ERR1YOR393W 1314 nt6.64□□□□□ -1.35
VAM3Q12241 ERR2YPL281C 1314 nt6.64□□□□□ -1.35
VAM3Q12241 THI73YLR004C 1572 nt6.64□□□□□ -1.35
VAM3Q12241 YIP4YGL198W 708 nt6.63□□□□□ -1.35
VAM3Q12241 PEX28YHR150W 1740 nt6.63□□□□□ -1.35
VAM3Q12241 YMR007WYMR007W 381 nt6.63□□□□□ -1.35
VAM3Q12241 YOR300WYOR300W 309 nt6.63□□□□□ -1.35
VAM3Q12241 PDC5YLR134W 1692 nt6.62□□□□□ -1.35
VAM3Q12241 MTC6YHR151C 1581 nt6.62□□□□□ -1.35
VAM3Q12241 RMA1YKL132C 1293 nt6.62□□□□□ -1.35
VAM3Q12241 YLR030WYLR030W 792 nt6.62□□□□□ -1.35
VAM3Q12241 FCY1YPR062W 477 nt6.62□□□□□ -1.35
VAM3Q12241 RUP1YOR138C 2016 nt6.62□□□□□ -1.35
VAM3Q12241 HXT8YJL214W 1710 nt6.62□□□□□ -1.35
VAM3Q12241 YMR253CYMR253C 1245 nt6.61□□□□□ -1.35
VAM3Q12241 TPO1YLL028W 1761 nt6.61□□□□□ -1.35
VAM3Q12241 ACO1YLR304C 2337 nt6.61□□□□□ -1.35
VAM3Q12241 KDX1YKL161C 1302 nt6.59□□□□□ -1.35
VAM3Q12241 YPT31YER031C 672 nt6.59□□□□□ -1.35
VAM3Q12241 RCR1YBR005W 642 nt6.59□□□□□ -1.35
VAM3Q12241 SHC1YER096W 1539 nt6.59□□□□□ -1.35
VAM3Q12241 GNA1YFL017C 480 nt6.58□□□□□ -1.36
VAM3Q12241 PRE10YOR362C 867 nt6.58□□□□□ -1.36
VAM3Q12241 MAL31YBR298C 1845 nt6.57□□□□□ -1.36
VAM3Q12241 MAK32YCR019W 1092 nt6.57□□□□□ -1.36
VAM3Q12241 YER152W-AYER152W-A 567 nt6.57□□□□□ -1.36
VAM3Q12241 YJL160CYJL160C 864 nt6.57□□□□□ -1.36
VAM3Q12241 YPL277CYPL277C 1464 nt6.57□□□□□ -1.36
VAM3Q12241 BIM1YER016W 1035 nt6.56□□□□□ -1.36
VAM3Q12241 YER156CYER156C 1017 nt6.56□□□□□ -1.36
VAM3Q12241 YHC3YJL059W 1227 nt6.56□□□□□ -1.36
VAM3Q12241 RCF2YNR018W 675 nt6.56□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 22.9 ms