Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
IFFO1Q0D2I5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
IFFO1Q0D2I5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
IFFO1Q0D2I5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
IFFO1Q0D2I5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
IFFO1Q0D2I5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
IFFO1Q0D2I5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
IFFO1Q0D2I5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
IFFO1Q0D2I5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
IFFO1Q0D2I5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
IFFO1Q0D2I5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
IFFO1Q0D2I5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
IFFO1Q0D2I5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
IFFO1Q0D2I5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
IFFO1Q0D2I5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
IFFO1Q0D2I5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
IFFO1Q0D2I5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
IFFO1Q0D2I5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
IFFO1Q0D2I5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
IFFO1Q0D2I5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
IFFO1Q0D2I5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
IFFO1Q0D2I5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
IFFO1Q0D2I5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
IFFO1Q0D2I5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
IFFO1Q0D2I5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
IFFO1Q0D2I5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
IFFO1Q0D2I5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
IFFO1Q0D2I5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
IFFO1Q0D2I5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
IFFO1Q0D2I5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
IFFO1Q0D2I5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
IFFO1Q0D2I5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
IFFO1Q0D2I5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
IFFO1Q0D2I5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
IFFO1Q0D2I5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
IFFO1Q0D2I5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
IFFO1Q0D2I5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
IFFO1Q0D2I5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
IFFO1Q0D2I5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
IFFO1Q0D2I5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
IFFO1Q0D2I5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
IFFO1Q0D2I5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
IFFO1Q0D2I5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
IFFO1Q0D2I5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
IFFO1Q0D2I5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IFFO1Q0D2I5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IFFO1Q0D2I5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
IFFO1Q0D2I5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
IFFO1Q0D2I5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
IFFO1Q0D2I5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
IFFO1Q0D2I5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
IFFO1Q0D2I5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFFO1Q0D2I5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
IFFO1Q0D2I5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
IFFO1Q0D2I5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
IFFO1Q0D2I5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
IFFO1Q0D2I5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
IFFO1Q0D2I5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
IFFO1Q0D2I5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IFFO1Q0D2I5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IFFO1Q0D2I5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
IFFO1Q0D2I5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
IFFO1Q0D2I5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
IFFO1Q0D2I5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IFFO1Q0D2I5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
IFFO1Q0D2I5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFFO1Q0D2I5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFFO1Q0D2I5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFFO1Q0D2I5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFFO1Q0D2I5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFFO1Q0D2I5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IFFO1Q0D2I5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
IFFO1Q0D2I5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
IFFO1Q0D2I5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IFFO1Q0D2I5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
IFFO1Q0D2I5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
IFFO1Q0D2I5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IFFO1Q0D2I5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IFFO1Q0D2I5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IFFO1Q0D2I5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
IFFO1Q0D2I5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IFFO1Q0D2I5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
IFFO1Q0D2I5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
IFFO1Q0D2I5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
IFFO1Q0D2I5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFFO1Q0D2I5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFFO1Q0D2I5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFFO1Q0D2I5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFFO1Q0D2I5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFFO1Q0D2I5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFFO1Q0D2I5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFFO1Q0D2I5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFFO1Q0D2I5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFFO1Q0D2I5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
IFFO1Q0D2I5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFFO1Q0D2I5 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFFO1Q0D2I5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFFO1Q0D2I5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFFO1Q0D2I5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFFO1Q0D2I5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms