Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SSRP1Q08945 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SSRP1Q08945 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SSRP1Q08945 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SSRP1Q08945 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SSRP1Q08945 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SSRP1Q08945 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SSRP1Q08945 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SSRP1Q08945 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
SSRP1Q08945 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SSRP1Q08945 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SSRP1Q08945 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SSRP1Q08945 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SSRP1Q08945 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SSRP1Q08945 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SSRP1Q08945 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
SSRP1Q08945 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SSRP1Q08945 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SSRP1Q08945 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SSRP1Q08945 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
SSRP1Q08945 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SSRP1Q08945 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SSRP1Q08945 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SSRP1Q08945 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SSRP1Q08945 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SSRP1Q08945 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SSRP1Q08945 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SSRP1Q08945 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SSRP1Q08945 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SSRP1Q08945 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SSRP1Q08945 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SSRP1Q08945 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SSRP1Q08945 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SSRP1Q08945 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
SSRP1Q08945 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
SSRP1Q08945 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
SSRP1Q08945 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SSRP1Q08945 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SSRP1Q08945 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SSRP1Q08945 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SSRP1Q08945 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SSRP1Q08945 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SSRP1Q08945 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SSRP1Q08945 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SSRP1Q08945 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SSRP1Q08945 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
SSRP1Q08945 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
SSRP1Q08945 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
SSRP1Q08945 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SSRP1Q08945 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SSRP1Q08945 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SSRP1Q08945 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SSRP1Q08945 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SSRP1Q08945 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SSRP1Q08945 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SSRP1Q08945 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SSRP1Q08945 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SSRP1Q08945 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
SSRP1Q08945 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SSRP1Q08945 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SSRP1Q08945 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
SSRP1Q08945 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
SSRP1Q08945 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
SSRP1Q08945 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
SSRP1Q08945 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
SSRP1Q08945 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
SSRP1Q08945 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
SSRP1Q08945 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
SSRP1Q08945 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
SSRP1Q08945 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SSRP1Q08945 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
SSRP1Q08945 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SSRP1Q08945 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SSRP1Q08945 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SSRP1Q08945 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SSRP1Q08945 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SSRP1Q08945 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SSRP1Q08945 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SSRP1Q08945 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SSRP1Q08945 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SSRP1Q08945 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SSRP1Q08945 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SSRP1Q08945 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SSRP1Q08945 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SSRP1Q08945 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
SSRP1Q08945 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SSRP1Q08945 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SSRP1Q08945 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SSRP1Q08945 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SSRP1Q08945 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SSRP1Q08945 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SSRP1Q08945 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SSRP1Q08945 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SSRP1Q08945 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SSRP1Q08945 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SSRP1Q08945 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SSRP1Q08945 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SSRP1Q08945 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SSRP1Q08945 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SSRP1Q08945 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 239.1 ms