Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SPOCK1Q08629 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPOCK1Q08629 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPOCK1Q08629 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPOCK1Q08629 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPOCK1Q08629 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SPOCK1Q08629 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPOCK1Q08629 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPOCK1Q08629 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPOCK1Q08629 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPOCK1Q08629 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPOCK1Q08629 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPOCK1Q08629 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPOCK1Q08629 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPOCK1Q08629 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPOCK1Q08629 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPOCK1Q08629 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPOCK1Q08629 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SPOCK1Q08629 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPOCK1Q08629 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPOCK1Q08629 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPOCK1Q08629 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPOCK1Q08629 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPOCK1Q08629 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPOCK1Q08629 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPOCK1Q08629 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPOCK1Q08629 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPOCK1Q08629 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPOCK1Q08629 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPOCK1Q08629 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPOCK1Q08629 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPOCK1Q08629 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPOCK1Q08629 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPOCK1Q08629 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPOCK1Q08629 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPOCK1Q08629 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPOCK1Q08629 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SPOCK1Q08629 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPOCK1Q08629 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPOCK1Q08629 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPOCK1Q08629 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SPOCK1Q08629 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SPOCK1Q08629 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SPOCK1Q08629 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SPOCK1Q08629 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SPOCK1Q08629 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SPOCK1Q08629 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SPOCK1Q08629 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SPOCK1Q08629 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SPOCK1Q08629 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPOCK1Q08629 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPOCK1Q08629 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPOCK1Q08629 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPOCK1Q08629 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPOCK1Q08629 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPOCK1Q08629 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPOCK1Q08629 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPOCK1Q08629 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPOCK1Q08629 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPOCK1Q08629 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPOCK1Q08629 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPOCK1Q08629 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPOCK1Q08629 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPOCK1Q08629 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPOCK1Q08629 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPOCK1Q08629 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPOCK1Q08629 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPOCK1Q08629 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SPOCK1Q08629 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPOCK1Q08629 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPOCK1Q08629 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPOCK1Q08629 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPOCK1Q08629 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPOCK1Q08629 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPOCK1Q08629 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPOCK1Q08629 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPOCK1Q08629 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPOCK1Q08629 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPOCK1Q08629 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPOCK1Q08629 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPOCK1Q08629 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPOCK1Q08629 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SPOCK1Q08629 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SPOCK1Q08629 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPOCK1Q08629 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPOCK1Q08629 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPOCK1Q08629 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPOCK1Q08629 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPOCK1Q08629 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPOCK1Q08629 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPOCK1Q08629 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPOCK1Q08629 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPOCK1Q08629 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPOCK1Q08629 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SPOCK1Q08629 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPOCK1Q08629 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPOCK1Q08629 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPOCK1Q08629 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPOCK1Q08629 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPOCK1Q08629 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.1 ms