Protein–RNA interactions for Protein: Q08109

HRD1, ERAD-associated E3 ubiquitin-protein ligase HRD1, yeastyeast

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HRD1Q08109 DIP5YPL265W 1827 nt6.54□□□□□ -1.36
HRD1Q08109 HTS1YPR033C 1641 nt6.54□□□□□ -1.36
HRD1Q08109 CAK1YFL029C 1107 nt6.53□□□□□ -1.36
HRD1Q08109 YGR210CYGR210C 1236 nt6.53□□□□□ -1.36
HRD1Q08109 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt6.53□□□□□ -1.36
HRD1Q08109 PUP3YER094C 618 nt6.52□□□□□ -1.37
HRD1Q08109 RPL2AYFR031C-A 765 nt6.52□□□□□ -1.37
HRD1Q08109 SEN2YLR105C 1134 nt6.52□□□□□ -1.37
HRD1Q08109 CRN1YLR429W 1956 nt6.51□□□□□ -1.37
HRD1Q08109 YEL034C-AYEL034C-A 603 nt6.51□□□□□ -1.37
HRD1Q08109 RRT14YIL127C 621 nt6.51□□□□□ -1.37
HRD1Q08109 LSP1YPL004C 1026 nt6.51□□□□□ -1.37
HRD1Q08109 YBL111CYBL111C 2004 nt6.5□□□□□ -1.37
HRD1Q08109 EDC3YEL015W 1656 nt6.49□□□□□ -1.37
HRD1Q08109 WSC4YHL028W 1818 nt6.49□□□□□ -1.37
HRD1Q08109 ARO3YDR035W 1113 nt6.49□□□□□ -1.37
HRD1Q08109 YJL064WYJL064W 396 nt6.49□□□□□ -1.37
HRD1Q08109 PMT7YDR307W 1989 nt6.49□□□□□ -1.37
HRD1Q08109 PRE10YOR362C 867 nt6.48□□□□□ -1.37
HRD1Q08109 YPL108WYPL108W 507 nt6.48□□□□□ -1.37
HRD1Q08109 ALG7YBR243C 1347 nt6.48□□□□□ -1.37
HRD1Q08109 SAM50YNL026W 1455 nt6.47□□□□□ -1.37
HRD1Q08109 TGA1tA(UGC)A 73 nt6.47□□□□□ -1.37
HRD1Q08109 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt6.47□□□□□ -1.37
HRD1Q08109 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt6.47□□□□□ -1.37
HRD1Q08109 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt6.47□□□□□ -1.37
HRD1Q08109 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt6.47□□□□□ -1.37
HRD1Q08109 SNP1YIL061C 903 nt6.47□□□□□ -1.37
HRD1Q08109 HSM3YBR272C 1443 nt6.47□□□□□ -1.37
HRD1Q08109 TOS2YGR221C 1869 nt6.47□□□□□ -1.37
HRD1Q08109 POB3YML069W 1659 nt6.46□□□□□ -1.37
HRD1Q08109 NAP1YKR048C 1254 nt6.46□□□□□ -1.38
HRD1Q08109 PAU19YMR325W 375 nt6.46□□□□□ -1.38
HRD1Q08109 FCY1YPR062W 477 nt6.46□□□□□ -1.38
HRD1Q08109 ACO1YLR304C 2337 nt6.45□□□□□ -1.38
HRD1Q08109 HXT8YJL214W 1710 nt6.45□□□□□ -1.38
HRD1Q08109 TES1YJR019C 1050 nt6.45□□□□□ -1.38
HRD1Q08109 YPL264CYPL264C 1062 nt6.45□□□□□ -1.38
HRD1Q08109 SHC1YER096W 1539 nt6.45□□□□□ -1.38
HRD1Q08109 PRP2YNR011C 2631 nt6.45□□□□□ -1.38
HRD1Q08109 RSC9YML127W 1746 nt6.45□□□□□ -1.38
HRD1Q08109 AGP2YBR132C 1791 nt6.44□□□□□ -1.38
HRD1Q08109 RRT6YGL146C 936 nt6.44□□□□□ -1.38
HRD1Q08109 APT1YML022W 564 nt6.44□□□□□ -1.38
HRD1Q08109 YMR206WYMR206W 942 nt6.44□□□□□ -1.38
HRD1Q08109 MNN9YPL050C 1188 nt6.44□□□□□ -1.38
HRD1Q08109 YPR084WYPR084W 1371 nt6.44□□□□□ -1.38
HRD1Q08109 CKB1YGL019W 837 nt6.43□□□□□ -1.38
HRD1Q08109 PMU1YKL128C 888 nt6.43□□□□□ -1.38
HRD1Q08109 MET13YGL125W 1803 nt6.43□□□□□ -1.38
HRD1Q08109 ICL2YPR006C 1728 nt6.42□□□□□ -1.38
HRD1Q08109 ADE17YMR120C 1779 nt6.42□□□□□ -1.38
HRD1Q08109 CDA1YLR307W 906 nt6.42□□□□□ -1.38
HRD1Q08109 MTC6YHR151C 1581 nt6.42□□□□□ -1.38
HRD1Q08109 TIM50YPL063W 1431 nt6.42□□□□□ -1.38
HRD1Q08109 AVL9YLR114C 2295 nt6.41□□□□□ -1.38
HRD1Q08109 VTS1YOR359W 1572 nt6.41□□□□□ -1.38
HRD1Q08109 TRR1YDR353W 960 nt6.4□□□□□ -1.38
HRD1Q08109 ELP6YMR312W 822 nt6.4□□□□□ -1.38
HRD1Q08109 ARG7YMR062C 1326 nt6.4□□□□□ -1.39
HRD1Q08109 SGF73YGL066W 1974 nt6.38□□□□□ -1.39
HRD1Q08109 ECM27YJR106W 2178 nt6.38□□□□□ -1.39
HRD1Q08109 YIP4YGL198W 708 nt6.38□□□□□ -1.39
HRD1Q08109 NMD5YJR132W 3147 nt6.37□□□□□ -1.39
HRD1Q08109 JHD1YER051W 1479 nt6.37□□□□□ -1.39
HRD1Q08109 YCP4YCR004C 744 nt6.37□□□□□ -1.39
HRD1Q08109 BXI1YNL305C 894 nt6.37□□□□□ -1.39
HRD1Q08109 ASN2YGR124W 1719 nt6.36□□□□□ -1.39
HRD1Q08109 YOS9YDR057W 1629 nt6.36□□□□□ -1.39
HRD1Q08109 HAM1YJR069C 594 nt6.36□□□□□ -1.39
HRD1Q08109 YMR007WYMR007W 381 nt6.36□□□□□ -1.39
HRD1Q08109 RCR1YBR005W 642 nt6.36□□□□□ -1.39
HRD1Q08109 RPS6AYPL090C 711 nt6.36□□□□□ -1.39
HRD1Q08109 AOS1YPR180W 1044 nt6.36□□□□□ -1.39
HRD1Q08109 RPS6BYBR181C 711 nt6.36□□□□□ -1.39
HRD1Q08109 HXT9YJL219W 1704 nt6.36□□□□□ -1.39
HRD1Q08109 SGE1YPR198W 1632 nt6.36□□□□□ -1.39
HRD1Q08109 PEX28YHR150W 1740 nt6.35□□□□□ -1.39
HRD1Q08109 PMT1YDL095W 2454 nt6.34□□□□□ -1.39
HRD1Q08109 MFT1YML062C 1179 nt6.34□□□□□ -1.39
HRD1Q08109 TPO1YLL028W 1761 nt6.34□□□□□ -1.4
HRD1Q08109 YER156CYER156C 1017 nt6.33□□□□□ -1.4
HRD1Q08109 YHR033WYHR033W 1272 nt6.33□□□□□ -1.4
HRD1Q08109 RCF2YNR018W 675 nt6.33□□□□□ -1.4
HRD1Q08109 DAL7YIR031C 1665 nt6.33□□□□□ -1.4
HRD1Q08109 ERG12YMR208W 1332 nt6.32□□□□□ -1.4
HRD1Q08109 SSC1YJR045C 1965 nt6.32□□□□□ -1.4
HRD1Q08109 PET18YCR020C 648 nt6.32□□□□□ -1.4
HRD1Q08109 YJL160CYJL160C 864 nt6.32□□□□□ -1.4
HRD1Q08109 PET10YKR046C 852 nt6.32□□□□□ -1.4
HRD1Q08109 LEO1YOR123C 1395 nt6.31□□□□□ -1.4
HRD1Q08109 SWM1YDR260C 513 nt6.31□□□□□ -1.4
HRD1Q08109 DST1YGL043W 930 nt6.31□□□□□ -1.4
HRD1Q08109 RUP1YOR138C 2016 nt6.31□□□□□ -1.4
HRD1Q08109 PPS1YBR276C 2424 nt6.3□□□□□ -1.4
HRD1Q08109 ATP2YJR121W 1536 nt6.3□□□□□ -1.4
HRD1Q08109 PDC5YLR134W 1692 nt6.3□□□□□ -1.4
HRD1Q08109 SNF7YLR025W 723 nt6.29□□□□□ -1.4
HRD1Q08109 YLR030WYLR030W 792 nt6.29□□□□□ -1.4
HRD1Q08109 YOR389WYOR389W 1875 nt6.28□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 71.4 ms