Protein–RNA interactions for Protein: Q07869

PPARA, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARAQ07869 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PPARAQ07869 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PPARAQ07869 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PPARAQ07869 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PPARAQ07869 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PPARAQ07869 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
PPARAQ07869 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PPARAQ07869 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PPARAQ07869 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PPARAQ07869 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PPARAQ07869 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PPARAQ07869 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PPARAQ07869 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PPARAQ07869 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PPARAQ07869 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PPARAQ07869 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PPARAQ07869 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PPARAQ07869 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PPARAQ07869 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PPARAQ07869 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PPARAQ07869 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PPARAQ07869 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PPARAQ07869 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PPARAQ07869 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PPARAQ07869 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PPARAQ07869 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PPARAQ07869 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PPARAQ07869 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PPARAQ07869 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PPARAQ07869 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PPARAQ07869 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PPARAQ07869 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PPARAQ07869 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PPARAQ07869 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PPARAQ07869 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
PPARAQ07869 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PPARAQ07869 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PPARAQ07869 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PPARAQ07869 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PPARAQ07869 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PPARAQ07869 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PPARAQ07869 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PPARAQ07869 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PPARAQ07869 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PPARAQ07869 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PPARAQ07869 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
PPARAQ07869 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PPARAQ07869 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PPARAQ07869 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PPARAQ07869 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PPARAQ07869 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PPARAQ07869 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PPARAQ07869 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PPARAQ07869 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PPARAQ07869 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
PPARAQ07869 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PPARAQ07869 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PPARAQ07869 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PPARAQ07869 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PPARAQ07869 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PPARAQ07869 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PPARAQ07869 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PPARAQ07869 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PPARAQ07869 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PPARAQ07869 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PPARAQ07869 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PPARAQ07869 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PPARAQ07869 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PPARAQ07869 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PPARAQ07869 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PPARAQ07869 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
PPARAQ07869 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PPARAQ07869 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PPARAQ07869 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PPARAQ07869 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PPARAQ07869 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PPARAQ07869 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PPARAQ07869 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PPARAQ07869 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PPARAQ07869 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PPARAQ07869 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PPARAQ07869 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
PPARAQ07869 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PPARAQ07869 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PPARAQ07869 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PPARAQ07869 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PPARAQ07869 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PPARAQ07869 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PPARAQ07869 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PPARAQ07869 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PPARAQ07869 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PPARAQ07869 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PPARAQ07869 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PPARAQ07869 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PPARAQ07869 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PPARAQ07869 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PPARAQ07869 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PPARAQ07869 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
PPARAQ07869 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PPARAQ07869 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms