Protein–RNA interactions for Protein: Q05066

SRY, Sex-determining region Y protein, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRYQ05066 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRYQ05066 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRYQ05066 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRYQ05066 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRYQ05066 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRYQ05066 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRYQ05066 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRYQ05066 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRYQ05066 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRYQ05066 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRYQ05066 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRYQ05066 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRYQ05066 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRYQ05066 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRYQ05066 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRYQ05066 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRYQ05066 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRYQ05066 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRYQ05066 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRYQ05066 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRYQ05066 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRYQ05066 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRYQ05066 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRYQ05066 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRYQ05066 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRYQ05066 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SRYQ05066 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRYQ05066 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRYQ05066 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRYQ05066 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SRYQ05066 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRYQ05066 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRYQ05066 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRYQ05066 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRYQ05066 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRYQ05066 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRYQ05066 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRYQ05066 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRYQ05066 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRYQ05066 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRYQ05066 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SRYQ05066 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRYQ05066 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRYQ05066 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRYQ05066 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRYQ05066 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRYQ05066 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SRYQ05066 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRYQ05066 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRYQ05066 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRYQ05066 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRYQ05066 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRYQ05066 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRYQ05066 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRYQ05066 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRYQ05066 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRYQ05066 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRYQ05066 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRYQ05066 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRYQ05066 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRYQ05066 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRYQ05066 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRYQ05066 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRYQ05066 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRYQ05066 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRYQ05066 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRYQ05066 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRYQ05066 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRYQ05066 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRYQ05066 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRYQ05066 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRYQ05066 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRYQ05066 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRYQ05066 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRYQ05066 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRYQ05066 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SRYQ05066 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRYQ05066 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRYQ05066 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRYQ05066 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRYQ05066 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRYQ05066 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRYQ05066 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRYQ05066 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRYQ05066 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRYQ05066 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRYQ05066 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRYQ05066 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRYQ05066 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRYQ05066 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRYQ05066 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRYQ05066 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRYQ05066 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRYQ05066 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRYQ05066 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRYQ05066 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRYQ05066 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRYQ05066 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRYQ05066 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRYQ05066 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms