Protein–RNA interactions for Protein: Q03403

TFF2, Trefoil factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF2Q03403 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TFF2Q03403 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TFF2Q03403 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TFF2Q03403 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TFF2Q03403 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TFF2Q03403 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TFF2Q03403 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TFF2Q03403 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TFF2Q03403 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TFF2Q03403 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TFF2Q03403 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TFF2Q03403 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TFF2Q03403 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TFF2Q03403 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TFF2Q03403 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TFF2Q03403 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TFF2Q03403 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TFF2Q03403 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TFF2Q03403 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TFF2Q03403 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TFF2Q03403 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TFF2Q03403 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TFF2Q03403 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TFF2Q03403 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TFF2Q03403 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TFF2Q03403 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TFF2Q03403 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TFF2Q03403 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TFF2Q03403 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TFF2Q03403 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TFF2Q03403 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TFF2Q03403 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TFF2Q03403 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TFF2Q03403 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TFF2Q03403 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TFF2Q03403 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TFF2Q03403 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TFF2Q03403 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TFF2Q03403 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TFF2Q03403 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TFF2Q03403 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TFF2Q03403 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TFF2Q03403 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TFF2Q03403 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TFF2Q03403 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TFF2Q03403 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TFF2Q03403 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TFF2Q03403 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TFF2Q03403 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TFF2Q03403 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TFF2Q03403 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TFF2Q03403 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TFF2Q03403 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TFF2Q03403 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TFF2Q03403 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TFF2Q03403 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TFF2Q03403 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TFF2Q03403 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TFF2Q03403 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TFF2Q03403 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TFF2Q03403 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TFF2Q03403 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TFF2Q03403 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TFF2Q03403 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
TFF2Q03403 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TFF2Q03403 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TFF2Q03403 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TFF2Q03403 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TFF2Q03403 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TFF2Q03403 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TFF2Q03403 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TFF2Q03403 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TFF2Q03403 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TFF2Q03403 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TFF2Q03403 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TFF2Q03403 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TFF2Q03403 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TFF2Q03403 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TFF2Q03403 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TFF2Q03403 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TFF2Q03403 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TFF2Q03403 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TFF2Q03403 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TFF2Q03403 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TFF2Q03403 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TFF2Q03403 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TFF2Q03403 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TFF2Q03403 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TFF2Q03403 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TFF2Q03403 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TFF2Q03403 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TFF2Q03403 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TFF2Q03403 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TFF2Q03403 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TFF2Q03403 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TFF2Q03403 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TFF2Q03403 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TFF2Q03403 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TFF2Q03403 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TFF2Q03403 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms