Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAV1Q03135 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAV1Q03135 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAV1Q03135 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAV1Q03135 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAV1Q03135 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAV1Q03135 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CAV1Q03135 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CAV1Q03135 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CAV1Q03135 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CAV1Q03135 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CAV1Q03135 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CAV1Q03135 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CAV1Q03135 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAV1Q03135 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CAV1Q03135 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAV1Q03135 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAV1Q03135 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAV1Q03135 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAV1Q03135 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAV1Q03135 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAV1Q03135 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAV1Q03135 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAV1Q03135 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAV1Q03135 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAV1Q03135 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAV1Q03135 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAV1Q03135 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAV1Q03135 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAV1Q03135 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAV1Q03135 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAV1Q03135 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAV1Q03135 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAV1Q03135 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAV1Q03135 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAV1Q03135 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAV1Q03135 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CAV1Q03135 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CAV1Q03135 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CAV1Q03135 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CAV1Q03135 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CAV1Q03135 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CAV1Q03135 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CAV1Q03135 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CAV1Q03135 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CAV1Q03135 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CAV1Q03135 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CAV1Q03135 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CAV1Q03135 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CAV1Q03135 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CAV1Q03135 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CAV1Q03135 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CAV1Q03135 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CAV1Q03135 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CAV1Q03135 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CAV1Q03135 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CAV1Q03135 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CAV1Q03135 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CAV1Q03135 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CAV1Q03135 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CAV1Q03135 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CAV1Q03135 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CAV1Q03135 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CAV1Q03135 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CAV1Q03135 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAV1Q03135 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAV1Q03135 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAV1Q03135 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAV1Q03135 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CAV1Q03135 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAV1Q03135 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAV1Q03135 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CAV1Q03135 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAV1Q03135 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CAV1Q03135 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CAV1Q03135 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CAV1Q03135 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CAV1Q03135 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CAV1Q03135 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAV1Q03135 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAV1Q03135 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAV1Q03135 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAV1Q03135 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAV1Q03135 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAV1Q03135 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CAV1Q03135 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAV1Q03135 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAV1Q03135 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CAV1Q03135 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAV1Q03135 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAV1Q03135 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAV1Q03135 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAV1Q03135 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CAV1Q03135 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAV1Q03135 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAV1Q03135 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAV1Q03135 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAV1Q03135 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAV1Q03135 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAV1Q03135 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms