Protein–RNA interactions for Protein: Q02447

SP3, Transcription factor Sp3, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP3Q02447 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SP3Q02447 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
SP3Q02447 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SP3Q02447 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SP3Q02447 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
SP3Q02447 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
SP3Q02447 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SP3Q02447 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SP3Q02447 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SP3Q02447 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SP3Q02447 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SP3Q02447 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SP3Q02447 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SP3Q02447 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SP3Q02447 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SP3Q02447 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SP3Q02447 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SP3Q02447 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
SP3Q02447 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SP3Q02447 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
SP3Q02447 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SP3Q02447 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SP3Q02447 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SP3Q02447 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SP3Q02447 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SP3Q02447 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
SP3Q02447 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SP3Q02447 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SP3Q02447 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
SP3Q02447 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SP3Q02447 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SP3Q02447 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SP3Q02447 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SP3Q02447 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SP3Q02447 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SP3Q02447 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
SP3Q02447 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SP3Q02447 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
SP3Q02447 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
SP3Q02447 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SP3Q02447 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SP3Q02447 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SP3Q02447 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SP3Q02447 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SP3Q02447 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SP3Q02447 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SP3Q02447 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
SP3Q02447 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SP3Q02447 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SP3Q02447 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SP3Q02447 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SP3Q02447 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SP3Q02447 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SP3Q02447 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
SP3Q02447 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SP3Q02447 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SP3Q02447 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SP3Q02447 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SP3Q02447 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SP3Q02447 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SP3Q02447 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SP3Q02447 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SP3Q02447 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SP3Q02447 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SP3Q02447 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
SP3Q02447 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SP3Q02447 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SP3Q02447 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SP3Q02447 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SP3Q02447 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
SP3Q02447 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
SP3Q02447 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SP3Q02447 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SP3Q02447 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SP3Q02447 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SP3Q02447 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SP3Q02447 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SP3Q02447 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SP3Q02447 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SP3Q02447 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SP3Q02447 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SP3Q02447 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SP3Q02447 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SP3Q02447 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SP3Q02447 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SP3Q02447 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SP3Q02447 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SP3Q02447 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SP3Q02447 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SP3Q02447 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SP3Q02447 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SP3Q02447 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SP3Q02447 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SP3Q02447 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SP3Q02447 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SP3Q02447 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SP3Q02447 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SP3Q02447 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SP3Q02447 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SP3Q02447 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms