Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MS4A2Q01362 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MS4A2Q01362 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MS4A2Q01362 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MS4A2Q01362 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MS4A2Q01362 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MS4A2Q01362 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MS4A2Q01362 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MS4A2Q01362 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MS4A2Q01362 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MS4A2Q01362 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MS4A2Q01362 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MS4A2Q01362 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MS4A2Q01362 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MS4A2Q01362 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MS4A2Q01362 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MS4A2Q01362 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MS4A2Q01362 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MS4A2Q01362 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MS4A2Q01362 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MS4A2Q01362 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MS4A2Q01362 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MS4A2Q01362 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MS4A2Q01362 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MS4A2Q01362 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
MS4A2Q01362 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MS4A2Q01362 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MS4A2Q01362 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MS4A2Q01362 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MS4A2Q01362 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MS4A2Q01362 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MS4A2Q01362 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MS4A2Q01362 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MS4A2Q01362 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MS4A2Q01362 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MS4A2Q01362 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MS4A2Q01362 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MS4A2Q01362 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
MS4A2Q01362 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MS4A2Q01362 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MS4A2Q01362 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MS4A2Q01362 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MS4A2Q01362 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MS4A2Q01362 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MS4A2Q01362 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MS4A2Q01362 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MS4A2Q01362 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MS4A2Q01362 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MS4A2Q01362 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MS4A2Q01362 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MS4A2Q01362 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MS4A2Q01362 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MS4A2Q01362 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MS4A2Q01362 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MS4A2Q01362 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MS4A2Q01362 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MS4A2Q01362 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MS4A2Q01362 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MS4A2Q01362 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MS4A2Q01362 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MS4A2Q01362 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MS4A2Q01362 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MS4A2Q01362 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MS4A2Q01362 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MS4A2Q01362 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MS4A2Q01362 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MS4A2Q01362 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MS4A2Q01362 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MS4A2Q01362 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MS4A2Q01362 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MS4A2Q01362 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MS4A2Q01362 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MS4A2Q01362 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MS4A2Q01362 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MS4A2Q01362 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MS4A2Q01362 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MS4A2Q01362 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MS4A2Q01362 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MS4A2Q01362 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MS4A2Q01362 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MS4A2Q01362 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MS4A2Q01362 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MS4A2Q01362 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MS4A2Q01362 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MS4A2Q01362 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MS4A2Q01362 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MS4A2Q01362 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MS4A2Q01362 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MS4A2Q01362 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MS4A2Q01362 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MS4A2Q01362 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MS4A2Q01362 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MS4A2Q01362 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MS4A2Q01362 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MS4A2Q01362 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MS4A2Q01362 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MS4A2Q01362 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MS4A2Q01362 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MS4A2Q01362 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MS4A2Q01362 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms