Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
E2F1Q01094 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
E2F1Q01094 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
E2F1Q01094 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
E2F1Q01094 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
E2F1Q01094 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
E2F1Q01094 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
E2F1Q01094 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
E2F1Q01094 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
E2F1Q01094 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
E2F1Q01094 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
E2F1Q01094 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
E2F1Q01094 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
E2F1Q01094 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
E2F1Q01094 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
E2F1Q01094 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
E2F1Q01094 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
E2F1Q01094 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
E2F1Q01094 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
E2F1Q01094 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
E2F1Q01094 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
E2F1Q01094 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
E2F1Q01094 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
E2F1Q01094 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
E2F1Q01094 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
E2F1Q01094 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
E2F1Q01094 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
E2F1Q01094 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
E2F1Q01094 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
E2F1Q01094 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
E2F1Q01094 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
E2F1Q01094 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
E2F1Q01094 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
E2F1Q01094 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
E2F1Q01094 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
E2F1Q01094 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
E2F1Q01094 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
E2F1Q01094 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
E2F1Q01094 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
E2F1Q01094 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
E2F1Q01094 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
E2F1Q01094 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
E2F1Q01094 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
E2F1Q01094 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
E2F1Q01094 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
E2F1Q01094 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
E2F1Q01094 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
E2F1Q01094 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
E2F1Q01094 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
E2F1Q01094 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
E2F1Q01094 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
E2F1Q01094 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
E2F1Q01094 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
E2F1Q01094 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
E2F1Q01094 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
E2F1Q01094 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
E2F1Q01094 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
E2F1Q01094 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
E2F1Q01094 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
E2F1Q01094 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
E2F1Q01094 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
E2F1Q01094 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
E2F1Q01094 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
E2F1Q01094 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
E2F1Q01094 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
E2F1Q01094 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
E2F1Q01094 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
E2F1Q01094 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
E2F1Q01094 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
E2F1Q01094 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
E2F1Q01094 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
E2F1Q01094 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
E2F1Q01094 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
E2F1Q01094 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
E2F1Q01094 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
E2F1Q01094 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
E2F1Q01094 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
E2F1Q01094 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
E2F1Q01094 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
E2F1Q01094 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
E2F1Q01094 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
E2F1Q01094 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
E2F1Q01094 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
E2F1Q01094 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
E2F1Q01094 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
E2F1Q01094 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
E2F1Q01094 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
E2F1Q01094 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
E2F1Q01094 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
E2F1Q01094 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
E2F1Q01094 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
E2F1Q01094 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
E2F1Q01094 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
E2F1Q01094 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
E2F1Q01094 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
E2F1Q01094 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
E2F1Q01094 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
E2F1Q01094 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
E2F1Q01094 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
E2F1Q01094 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms