Protein–RNA interactions for Protein: P84074

HPCA, Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAP84074 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HPCAP84074 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HPCAP84074 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HPCAP84074 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HPCAP84074 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HPCAP84074 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HPCAP84074 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HPCAP84074 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HPCAP84074 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HPCAP84074 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HPCAP84074 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HPCAP84074 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HPCAP84074 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HPCAP84074 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HPCAP84074 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HPCAP84074 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HPCAP84074 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HPCAP84074 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HPCAP84074 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HPCAP84074 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HPCAP84074 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HPCAP84074 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HPCAP84074 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HPCAP84074 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HPCAP84074 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HPCAP84074 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HPCAP84074 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HPCAP84074 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HPCAP84074 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HPCAP84074 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HPCAP84074 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HPCAP84074 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HPCAP84074 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HPCAP84074 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HPCAP84074 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HPCAP84074 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HPCAP84074 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HPCAP84074 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HPCAP84074 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HPCAP84074 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HPCAP84074 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HPCAP84074 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HPCAP84074 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HPCAP84074 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HPCAP84074 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HPCAP84074 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
HPCAP84074 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HPCAP84074 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HPCAP84074 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HPCAP84074 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HPCAP84074 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HPCAP84074 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HPCAP84074 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HPCAP84074 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
HPCAP84074 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HPCAP84074 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HPCAP84074 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HPCAP84074 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HPCAP84074 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HPCAP84074 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HPCAP84074 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HPCAP84074 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HPCAP84074 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HPCAP84074 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HPCAP84074 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HPCAP84074 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HPCAP84074 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HPCAP84074 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HPCAP84074 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HPCAP84074 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HPCAP84074 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HPCAP84074 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HPCAP84074 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HPCAP84074 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HPCAP84074 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HPCAP84074 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HPCAP84074 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HPCAP84074 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HPCAP84074 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HPCAP84074 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HPCAP84074 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HPCAP84074 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HPCAP84074 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HPCAP84074 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HPCAP84074 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HPCAP84074 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HPCAP84074 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HPCAP84074 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HPCAP84074 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HPCAP84074 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HPCAP84074 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HPCAP84074 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HPCAP84074 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HPCAP84074 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HPCAP84074 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HPCAP84074 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HPCAP84074 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HPCAP84074 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HPCAP84074 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HPCAP84074 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 163.3 ms