Protein–RNA interactions for Protein: P82980

RBP5, Retinol-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP5P82980 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RBP5P82980 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RBP5P82980 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RBP5P82980 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RBP5P82980 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RBP5P82980 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RBP5P82980 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RBP5P82980 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RBP5P82980 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RBP5P82980 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RBP5P82980 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RBP5P82980 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RBP5P82980 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RBP5P82980 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RBP5P82980 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RBP5P82980 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RBP5P82980 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RBP5P82980 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RBP5P82980 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RBP5P82980 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RBP5P82980 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RBP5P82980 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RBP5P82980 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RBP5P82980 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RBP5P82980 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RBP5P82980 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RBP5P82980 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RBP5P82980 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RBP5P82980 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RBP5P82980 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RBP5P82980 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RBP5P82980 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RBP5P82980 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RBP5P82980 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
RBP5P82980 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RBP5P82980 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RBP5P82980 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RBP5P82980 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RBP5P82980 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RBP5P82980 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
RBP5P82980 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RBP5P82980 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RBP5P82980 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RBP5P82980 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RBP5P82980 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RBP5P82980 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RBP5P82980 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RBP5P82980 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RBP5P82980 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RBP5P82980 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RBP5P82980 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RBP5P82980 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RBP5P82980 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
RBP5P82980 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RBP5P82980 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RBP5P82980 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RBP5P82980 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RBP5P82980 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RBP5P82980 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RBP5P82980 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RBP5P82980 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RBP5P82980 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RBP5P82980 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RBP5P82980 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RBP5P82980 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RBP5P82980 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RBP5P82980 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RBP5P82980 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RBP5P82980 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RBP5P82980 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RBP5P82980 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RBP5P82980 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RBP5P82980 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RBP5P82980 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RBP5P82980 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RBP5P82980 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RBP5P82980 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
RBP5P82980 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RBP5P82980 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RBP5P82980 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RBP5P82980 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RBP5P82980 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RBP5P82980 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RBP5P82980 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RBP5P82980 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RBP5P82980 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RBP5P82980 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RBP5P82980 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RBP5P82980 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RBP5P82980 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RBP5P82980 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RBP5P82980 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RBP5P82980 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
RBP5P82980 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RBP5P82980 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RBP5P82980 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RBP5P82980 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RBP5P82980 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RBP5P82980 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RBP5P82980 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms