Protein–RNA interactions for Protein: P78549

NTHL1, Endonuclease III-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTHL1P78549 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NTHL1P78549 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NTHL1P78549 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NTHL1P78549 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NTHL1P78549 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NTHL1P78549 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NTHL1P78549 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NTHL1P78549 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NTHL1P78549 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NTHL1P78549 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NTHL1P78549 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NTHL1P78549 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NTHL1P78549 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NTHL1P78549 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NTHL1P78549 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NTHL1P78549 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NTHL1P78549 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NTHL1P78549 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NTHL1P78549 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NTHL1P78549 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NTHL1P78549 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NTHL1P78549 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NTHL1P78549 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NTHL1P78549 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NTHL1P78549 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NTHL1P78549 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NTHL1P78549 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NTHL1P78549 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NTHL1P78549 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NTHL1P78549 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NTHL1P78549 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NTHL1P78549 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NTHL1P78549 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NTHL1P78549 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NTHL1P78549 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NTHL1P78549 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
NTHL1P78549 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NTHL1P78549 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NTHL1P78549 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NTHL1P78549 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NTHL1P78549 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NTHL1P78549 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NTHL1P78549 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
NTHL1P78549 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NTHL1P78549 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NTHL1P78549 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NTHL1P78549 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NTHL1P78549 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NTHL1P78549 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NTHL1P78549 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NTHL1P78549 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NTHL1P78549 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NTHL1P78549 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NTHL1P78549 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NTHL1P78549 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NTHL1P78549 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NTHL1P78549 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NTHL1P78549 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NTHL1P78549 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NTHL1P78549 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NTHL1P78549 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NTHL1P78549 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NTHL1P78549 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NTHL1P78549 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NTHL1P78549 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NTHL1P78549 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NTHL1P78549 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
NTHL1P78549 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NTHL1P78549 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NTHL1P78549 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NTHL1P78549 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NTHL1P78549 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NTHL1P78549 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NTHL1P78549 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
NTHL1P78549 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NTHL1P78549 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NTHL1P78549 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NTHL1P78549 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
NTHL1P78549 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NTHL1P78549 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NTHL1P78549 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NTHL1P78549 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NTHL1P78549 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NTHL1P78549 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NTHL1P78549 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NTHL1P78549 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NTHL1P78549 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NTHL1P78549 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
NTHL1P78549 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NTHL1P78549 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NTHL1P78549 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
NTHL1P78549 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NTHL1P78549 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NTHL1P78549 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NTHL1P78549 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NTHL1P78549 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NTHL1P78549 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NTHL1P78549 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NTHL1P78549 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NTHL1P78549 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms