Protein–RNA interactions for Protein: P63267

ACTG2, Actin, gamma-enteric smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG2P63267 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTG2P63267 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ACTG2P63267 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTG2P63267 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTG2P63267 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTG2P63267 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTG2P63267 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTG2P63267 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTG2P63267 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTG2P63267 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTG2P63267 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTG2P63267 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTG2P63267 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTG2P63267 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTG2P63267 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTG2P63267 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTG2P63267 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTG2P63267 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTG2P63267 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTG2P63267 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTG2P63267 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTG2P63267 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTG2P63267 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACTG2P63267 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTG2P63267 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTG2P63267 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTG2P63267 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTG2P63267 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTG2P63267 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTG2P63267 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTG2P63267 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTG2P63267 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTG2P63267 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTG2P63267 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTG2P63267 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTG2P63267 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTG2P63267 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTG2P63267 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTG2P63267 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTG2P63267 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTG2P63267 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTG2P63267 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTG2P63267 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTG2P63267 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTG2P63267 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTG2P63267 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACTG2P63267 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTG2P63267 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTG2P63267 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTG2P63267 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTG2P63267 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTG2P63267 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACTG2P63267 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTG2P63267 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTG2P63267 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTG2P63267 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTG2P63267 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACTG2P63267 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTG2P63267 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTG2P63267 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACTG2P63267 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTG2P63267 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTG2P63267 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTG2P63267 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACTG2P63267 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTG2P63267 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTG2P63267 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTG2P63267 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTG2P63267 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTG2P63267 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTG2P63267 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTG2P63267 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTG2P63267 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTG2P63267 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACTG2P63267 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTG2P63267 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTG2P63267 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTG2P63267 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTG2P63267 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACTG2P63267 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTG2P63267 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTG2P63267 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTG2P63267 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTG2P63267 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTG2P63267 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTG2P63267 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTG2P63267 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTG2P63267 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACTG2P63267 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTG2P63267 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTG2P63267 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTG2P63267 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTG2P63267 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTG2P63267 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTG2P63267 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACTG2P63267 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTG2P63267 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTG2P63267 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTG2P63267 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTG2P63267 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms