Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERVK_113P63121 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERVK_113P63121 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERVK_113P63121 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERVK_113P63121 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERVK_113P63121 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERVK_113P63121 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERVK_113P63121 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERVK_113P63121 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERVK_113P63121 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113P63121 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113P63121 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113P63121 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113P63121 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113P63121 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113P63121 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113P63121 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113P63121 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113P63121 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113P63121 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERVK_113P63121 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERVK_113P63121 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERVK_113P63121 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERVK_113P63121 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HERVK_113P63121 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERVK_113P63121 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERVK_113P63121 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERVK_113P63121 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HERVK_113P63121 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113P63121 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113P63121 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113P63121 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113P63121 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113P63121 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113P63121 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113P63121 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HERVK_113P63121 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113P63121 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113P63121 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113P63121 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113P63121 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113P63121 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113P63121 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HERVK_113P63121 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HERVK_113P63121 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERVK_113P63121 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERVK_113P63121 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERVK_113P63121 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERVK_113P63121 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERVK_113P63121 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P63121 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P63121 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P63121 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P63121 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P63121 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P63121 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113P63121 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113P63121 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113P63121 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113P63121 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113P63121 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113P63121 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113P63121 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113P63121 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113P63121 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HERVK_113P63121 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113P63121 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113P63121 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113P63121 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113P63121 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HERVK_113P63121 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113P63121 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113P63121 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113P63121 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113P63121 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113P63121 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113P63121 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HERVK_113P63121 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERVK_113P63121 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERVK_113P63121 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERVK_113P63121 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERVK_113P63121 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERVK_113P63121 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HERVK_113P63121 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERVK_113P63121 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
HERVK_113P63121 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HERVK_113P63121 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HERVK_113P63121 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P63121 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P63121 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P63121 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P63121 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113P63121 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P63121 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P63121 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P63121 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P63121 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P63121 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P63121 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113P63121 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms