Protein–RNA interactions for Protein: P53990

IST1, IST1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IST1P53990 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IST1P53990 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IST1P53990 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IST1P53990 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IST1P53990 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IST1P53990 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IST1P53990 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IST1P53990 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IST1P53990 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IST1P53990 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IST1P53990 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IST1P53990 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IST1P53990 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
IST1P53990 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IST1P53990 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IST1P53990 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
IST1P53990 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
IST1P53990 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IST1P53990 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IST1P53990 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IST1P53990 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IST1P53990 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
IST1P53990 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
IST1P53990 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
IST1P53990 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IST1P53990 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IST1P53990 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IST1P53990 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
IST1P53990 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IST1P53990 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IST1P53990 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IST1P53990 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IST1P53990 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
IST1P53990 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IST1P53990 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IST1P53990 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IST1P53990 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IST1P53990 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IST1P53990 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IST1P53990 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IST1P53990 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IST1P53990 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IST1P53990 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
IST1P53990 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IST1P53990 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IST1P53990 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IST1P53990 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
IST1P53990 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IST1P53990 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IST1P53990 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IST1P53990 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IST1P53990 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IST1P53990 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IST1P53990 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IST1P53990 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IST1P53990 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IST1P53990 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IST1P53990 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IST1P53990 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IST1P53990 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IST1P53990 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IST1P53990 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IST1P53990 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IST1P53990 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IST1P53990 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IST1P53990 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IST1P53990 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
IST1P53990 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IST1P53990 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IST1P53990 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IST1P53990 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IST1P53990 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
IST1P53990 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IST1P53990 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IST1P53990 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IST1P53990 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IST1P53990 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IST1P53990 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IST1P53990 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IST1P53990 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IST1P53990 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IST1P53990 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IST1P53990 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IST1P53990 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IST1P53990 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IST1P53990 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
IST1P53990 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
IST1P53990 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
IST1P53990 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IST1P53990 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IST1P53990 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IST1P53990 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IST1P53990 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IST1P53990 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IST1P53990 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IST1P53990 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IST1P53990 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IST1P53990 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IST1P53990 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IST1P53990 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms