Protein–RNA interactions for Protein: P53794

SLC5A3, Sodium/myo-inositol cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A3P53794 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC5A3P53794 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC5A3P53794 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC5A3P53794 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC5A3P53794 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC5A3P53794 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC5A3P53794 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC5A3P53794 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC5A3P53794 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC5A3P53794 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC5A3P53794 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC5A3P53794 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC5A3P53794 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC5A3P53794 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC5A3P53794 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC5A3P53794 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC5A3P53794 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC5A3P53794 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC5A3P53794 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC5A3P53794 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC5A3P53794 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC5A3P53794 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC5A3P53794 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC5A3P53794 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC5A3P53794 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
SLC5A3P53794 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC5A3P53794 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC5A3P53794 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC5A3P53794 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC5A3P53794 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC5A3P53794 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC5A3P53794 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC5A3P53794 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC5A3P53794 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC5A3P53794 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC5A3P53794 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC5A3P53794 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC5A3P53794 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC5A3P53794 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC5A3P53794 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC5A3P53794 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC5A3P53794 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC5A3P53794 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC5A3P53794 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC5A3P53794 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC5A3P53794 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC5A3P53794 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC5A3P53794 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC5A3P53794 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC5A3P53794 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC5A3P53794 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC5A3P53794 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC5A3P53794 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC5A3P53794 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SLC5A3P53794 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC5A3P53794 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC5A3P53794 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC5A3P53794 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC5A3P53794 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC5A3P53794 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC5A3P53794 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC5A3P53794 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC5A3P53794 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC5A3P53794 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC5A3P53794 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC5A3P53794 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC5A3P53794 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC5A3P53794 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC5A3P53794 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC5A3P53794 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC5A3P53794 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC5A3P53794 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC5A3P53794 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC5A3P53794 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC5A3P53794 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC5A3P53794 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SLC5A3P53794 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SLC5A3P53794 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC5A3P53794 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC5A3P53794 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC5A3P53794 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC5A3P53794 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC5A3P53794 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC5A3P53794 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC5A3P53794 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC5A3P53794 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC5A3P53794 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC5A3P53794 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC5A3P53794 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC5A3P53794 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC5A3P53794 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC5A3P53794 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC5A3P53794 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC5A3P53794 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC5A3P53794 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC5A3P53794 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC5A3P53794 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC5A3P53794 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC5A3P53794 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC5A3P53794 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms