Protein–RNA interactions for Protein: P53680

AP2S1, AP-2 complex subunit sigma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1P53680 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP2S1P53680 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP2S1P53680 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP2S1P53680 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP2S1P53680 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP2S1P53680 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP2S1P53680 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP2S1P53680 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP2S1P53680 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
AP2S1P53680 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP2S1P53680 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP2S1P53680 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP2S1P53680 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AP2S1P53680 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AP2S1P53680 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AP2S1P53680 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AP2S1P53680 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AP2S1P53680 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AP2S1P53680 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AP2S1P53680 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.32■■□□□ 1
AP2S1P53680 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AP2S1P53680 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AP2S1P53680 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
AP2S1P53680 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AP2S1P53680 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AP2S1P53680 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AP2S1P53680 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AP2S1P53680 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
AP2S1P53680 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AP2S1P53680 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AP2S1P53680 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
AP2S1P53680 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
AP2S1P53680 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AP2S1P53680 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
AP2S1P53680 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
AP2S1P53680 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AP2S1P53680 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
AP2S1P53680 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.29■■□□□ 1
AP2S1P53680 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
AP2S1P53680 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
AP2S1P53680 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
AP2S1P53680 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
AP2S1P53680 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AP2S1P53680 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
AP2S1P53680 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
AP2S1P53680 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AP2S1P53680 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AP2S1P53680 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
AP2S1P53680 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AP2S1P53680 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
AP2S1P53680 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP2S1P53680 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP2S1P53680 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP2S1P53680 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP2S1P53680 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP2S1P53680 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
AP2S1P53680 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP2S1P53680 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP2S1P53680 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP2S1P53680 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
AP2S1P53680 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP2S1P53680 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AP2S1P53680 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AP2S1P53680 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AP2S1P53680 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AP2S1P53680 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AP2S1P53680 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AP2S1P53680 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AP2S1P53680 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AP2S1P53680 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AP2S1P53680 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AP2S1P53680 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AP2S1P53680 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AP2S1P53680 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AP2S1P53680 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AP2S1P53680 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AP2S1P53680 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AP2S1P53680 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AP2S1P53680 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AP2S1P53680 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AP2S1P53680 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AP2S1P53680 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AP2S1P53680 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
AP2S1P53680 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AP2S1P53680 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AP2S1P53680 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AP2S1P53680 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AP2S1P53680 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AP2S1P53680 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AP2S1P53680 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AP2S1P53680 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AP2S1P53680 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AP2S1P53680 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AP2S1P53680 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AP2S1P53680 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AP2S1P53680 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AP2S1P53680 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AP2S1P53680 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AP2S1P53680 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AP2S1P53680 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms