Protein–RNA interactions for Protein: P53384

NUBP1, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP1, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUBP1P53384 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NUBP1P53384 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUBP1P53384 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUBP1P53384 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUBP1P53384 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUBP1P53384 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUBP1P53384 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NUBP1P53384 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NUBP1P53384 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NUBP1P53384 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NUBP1P53384 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
NUBP1P53384 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NUBP1P53384 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NUBP1P53384 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NUBP1P53384 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUBP1P53384 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUBP1P53384 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUBP1P53384 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NUBP1P53384 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUBP1P53384 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NUBP1P53384 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUBP1P53384 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUBP1P53384 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUBP1P53384 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUBP1P53384 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NUBP1P53384 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUBP1P53384 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUBP1P53384 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUBP1P53384 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NUBP1P53384 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUBP1P53384 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUBP1P53384 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUBP1P53384 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NUBP1P53384 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NUBP1P53384 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NUBP1P53384 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NUBP1P53384 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NUBP1P53384 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NUBP1P53384 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUBP1P53384 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUBP1P53384 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUBP1P53384 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NUBP1P53384 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUBP1P53384 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUBP1P53384 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NUBP1P53384 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
NUBP1P53384 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NUBP1P53384 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
NUBP1P53384 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUBP1P53384 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NUBP1P53384 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NUBP1P53384 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUBP1P53384 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUBP1P53384 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUBP1P53384 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUBP1P53384 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NUBP1P53384 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUBP1P53384 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NUBP1P53384 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NUBP1P53384 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUBP1P53384 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUBP1P53384 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUBP1P53384 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NUBP1P53384 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NUBP1P53384 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NUBP1P53384 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUBP1P53384 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUBP1P53384 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUBP1P53384 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUBP1P53384 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUBP1P53384 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUBP1P53384 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUBP1P53384 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUBP1P53384 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUBP1P53384 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUBP1P53384 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUBP1P53384 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUBP1P53384 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUBP1P53384 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NUBP1P53384 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUBP1P53384 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUBP1P53384 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUBP1P53384 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUBP1P53384 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUBP1P53384 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NUBP1P53384 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NUBP1P53384 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUBP1P53384 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
NUBP1P53384 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUBP1P53384 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUBP1P53384 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUBP1P53384 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NUBP1P53384 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUBP1P53384 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUBP1P53384 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NUBP1P53384 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUBP1P53384 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUBP1P53384 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NUBP1P53384 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUBP1P53384 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms