Protein–RNA interactions for Protein: P52798

EFNA4, Ephrin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA4P52798 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
EFNA4P52798 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EFNA4P52798 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EFNA4P52798 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EFNA4P52798 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EFNA4P52798 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EFNA4P52798 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
EFNA4P52798 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EFNA4P52798 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EFNA4P52798 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EFNA4P52798 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
EFNA4P52798 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EFNA4P52798 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EFNA4P52798 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
EFNA4P52798 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
EFNA4P52798 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFNA4P52798 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFNA4P52798 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFNA4P52798 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFNA4P52798 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFNA4P52798 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFNA4P52798 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFNA4P52798 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFNA4P52798 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFNA4P52798 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFNA4P52798 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFNA4P52798 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFNA4P52798 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFNA4P52798 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
EFNA4P52798 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EFNA4P52798 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFNA4P52798 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFNA4P52798 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFNA4P52798 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFNA4P52798 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFNA4P52798 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFNA4P52798 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFNA4P52798 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFNA4P52798 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFNA4P52798 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFNA4P52798 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
EFNA4P52798 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
EFNA4P52798 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFNA4P52798 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFNA4P52798 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFNA4P52798 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFNA4P52798 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFNA4P52798 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EFNA4P52798 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EFNA4P52798 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EFNA4P52798 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFNA4P52798 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EFNA4P52798 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFNA4P52798 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EFNA4P52798 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EFNA4P52798 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFNA4P52798 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFNA4P52798 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFNA4P52798 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFNA4P52798 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EFNA4P52798 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFNA4P52798 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFNA4P52798 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
EFNA4P52798 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EFNA4P52798 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFNA4P52798 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFNA4P52798 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFNA4P52798 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EFNA4P52798 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EFNA4P52798 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
EFNA4P52798 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EFNA4P52798 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EFNA4P52798 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
EFNA4P52798 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
EFNA4P52798 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EFNA4P52798 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EFNA4P52798 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
EFNA4P52798 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EFNA4P52798 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EFNA4P52798 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EFNA4P52798 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.32■■□□□ 1
EFNA4P52798 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EFNA4P52798 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EFNA4P52798 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
EFNA4P52798 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
EFNA4P52798 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EFNA4P52798 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EFNA4P52798 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EFNA4P52798 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EFNA4P52798 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EFNA4P52798 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
EFNA4P52798 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EFNA4P52798 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EFNA4P52798 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EFNA4P52798 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EFNA4P52798 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EFNA4P52798 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EFNA4P52798 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EFNA4P52798 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EFNA4P52798 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms