Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ETV1P50549 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ETV1P50549 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ETV1P50549 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ETV1P50549 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ETV1P50549 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ETV1P50549 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ETV1P50549 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ETV1P50549 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ETV1P50549 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ETV1P50549 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ETV1P50549 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ETV1P50549 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ETV1P50549 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ETV1P50549 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ETV1P50549 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ETV1P50549 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ETV1P50549 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ETV1P50549 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ETV1P50549 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ETV1P50549 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ETV1P50549 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ETV1P50549 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ETV1P50549 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ETV1P50549 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ETV1P50549 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ETV1P50549 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ETV1P50549 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ETV1P50549 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ETV1P50549 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ETV1P50549 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ETV1P50549 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ETV1P50549 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ETV1P50549 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ETV1P50549 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ETV1P50549 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ETV1P50549 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ETV1P50549 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ETV1P50549 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ETV1P50549 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ETV1P50549 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ETV1P50549 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ETV1P50549 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ETV1P50549 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ETV1P50549 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ETV1P50549 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ETV1P50549 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ETV1P50549 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ETV1P50549 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ETV1P50549 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ETV1P50549 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ETV1P50549 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ETV1P50549 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ETV1P50549 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ETV1P50549 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ETV1P50549 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ETV1P50549 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ETV1P50549 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ETV1P50549 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ETV1P50549 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ETV1P50549 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ETV1P50549 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ETV1P50549 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ETV1P50549 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ETV1P50549 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ETV1P50549 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ETV1P50549 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ETV1P50549 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ETV1P50549 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ETV1P50549 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ETV1P50549 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ETV1P50549 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ETV1P50549 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ETV1P50549 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ETV1P50549 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
ETV1P50549 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ETV1P50549 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ETV1P50549 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ETV1P50549 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ETV1P50549 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ETV1P50549 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ETV1P50549 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ETV1P50549 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ETV1P50549 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ETV1P50549 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ETV1P50549 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ETV1P50549 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ETV1P50549 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ETV1P50549 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ETV1P50549 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ETV1P50549 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ETV1P50549 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ETV1P50549 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ETV1P50549 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ETV1P50549 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ETV1P50549 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ETV1P50549 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ETV1P50549 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ETV1P50549 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ETV1P50549 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms