Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CRIP1P50238 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CRIP1P50238 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CRIP1P50238 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CRIP1P50238 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CRIP1P50238 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CRIP1P50238 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CRIP1P50238 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CRIP1P50238 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CRIP1P50238 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CRIP1P50238 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CRIP1P50238 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CRIP1P50238 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CRIP1P50238 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CRIP1P50238 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CRIP1P50238 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CRIP1P50238 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CRIP1P50238 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CRIP1P50238 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CRIP1P50238 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CRIP1P50238 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CRIP1P50238 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CRIP1P50238 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CRIP1P50238 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CRIP1P50238 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CRIP1P50238 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CRIP1P50238 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CRIP1P50238 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CRIP1P50238 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CRIP1P50238 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CRIP1P50238 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CRIP1P50238 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CRIP1P50238 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CRIP1P50238 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CRIP1P50238 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CRIP1P50238 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CRIP1P50238 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CRIP1P50238 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CRIP1P50238 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CRIP1P50238 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CRIP1P50238 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CRIP1P50238 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CRIP1P50238 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CRIP1P50238 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CRIP1P50238 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CRIP1P50238 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CRIP1P50238 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CRIP1P50238 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CRIP1P50238 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CRIP1P50238 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CRIP1P50238 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CRIP1P50238 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CRIP1P50238 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CRIP1P50238 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CRIP1P50238 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CRIP1P50238 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CRIP1P50238 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CRIP1P50238 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CRIP1P50238 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CRIP1P50238 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CRIP1P50238 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CRIP1P50238 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CRIP1P50238 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CRIP1P50238 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CRIP1P50238 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CRIP1P50238 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CRIP1P50238 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CRIP1P50238 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CRIP1P50238 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CRIP1P50238 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CRIP1P50238 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CRIP1P50238 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CRIP1P50238 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CRIP1P50238 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CRIP1P50238 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CRIP1P50238 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CRIP1P50238 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CRIP1P50238 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CRIP1P50238 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CRIP1P50238 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CRIP1P50238 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CRIP1P50238 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CRIP1P50238 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CRIP1P50238 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CRIP1P50238 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CRIP1P50238 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CRIP1P50238 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CRIP1P50238 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CRIP1P50238 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CRIP1P50238 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CRIP1P50238 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CRIP1P50238 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CRIP1P50238 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CRIP1P50238 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CRIP1P50238 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CRIP1P50238 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CRIP1P50238 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CRIP1P50238 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CRIP1P50238 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CRIP1P50238 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms