Protein–RNA interactions for Protein: P49908

SELENOP, Selenoprotein P, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOPP49908 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SELENOPP49908 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SELENOPP49908 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SELENOPP49908 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SELENOPP49908 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SELENOPP49908 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SELENOPP49908 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SELENOPP49908 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SELENOPP49908 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SELENOPP49908 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SELENOPP49908 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SELENOPP49908 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SELENOPP49908 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SELENOPP49908 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SELENOPP49908 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SELENOPP49908 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SELENOPP49908 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SELENOPP49908 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SELENOPP49908 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SELENOPP49908 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SELENOPP49908 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SELENOPP49908 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SELENOPP49908 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SELENOPP49908 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SELENOPP49908 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SELENOPP49908 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SELENOPP49908 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SELENOPP49908 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SELENOPP49908 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SELENOPP49908 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SELENOPP49908 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SELENOPP49908 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SELENOPP49908 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SELENOPP49908 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SELENOPP49908 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SELENOPP49908 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SELENOPP49908 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SELENOPP49908 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SELENOPP49908 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SELENOPP49908 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SELENOPP49908 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SELENOPP49908 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SELENOPP49908 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SELENOPP49908 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SELENOPP49908 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SELENOPP49908 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SELENOPP49908 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SELENOPP49908 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SELENOPP49908 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SELENOPP49908 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SELENOPP49908 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SELENOPP49908 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SELENOPP49908 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SELENOPP49908 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SELENOPP49908 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SELENOPP49908 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SELENOPP49908 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SELENOPP49908 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SELENOPP49908 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SELENOPP49908 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SELENOPP49908 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SELENOPP49908 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SELENOPP49908 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SELENOPP49908 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SELENOPP49908 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SELENOPP49908 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SELENOPP49908 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SELENOPP49908 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SELENOPP49908 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SELENOPP49908 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SELENOPP49908 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SELENOPP49908 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SELENOPP49908 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SELENOPP49908 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SELENOPP49908 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SELENOPP49908 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SELENOPP49908 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SELENOPP49908 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SELENOPP49908 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SELENOPP49908 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SELENOPP49908 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SELENOPP49908 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SELENOPP49908 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SELENOPP49908 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SELENOPP49908 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SELENOPP49908 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SELENOPP49908 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SELENOPP49908 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SELENOPP49908 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SELENOPP49908 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SELENOPP49908 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SELENOPP49908 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SELENOPP49908 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SELENOPP49908 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SELENOPP49908 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SELENOPP49908 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SELENOPP49908 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SELENOPP49908 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SELENOPP49908 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SELENOPP49908 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms