Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FNTBP49356 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FNTBP49356 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FNTBP49356 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FNTBP49356 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
FNTBP49356 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FNTBP49356 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FNTBP49356 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FNTBP49356 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
FNTBP49356 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FNTBP49356 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FNTBP49356 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FNTBP49356 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FNTBP49356 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
FNTBP49356 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FNTBP49356 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FNTBP49356 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FNTBP49356 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FNTBP49356 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FNTBP49356 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FNTBP49356 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FNTBP49356 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FNTBP49356 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FNTBP49356 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FNTBP49356 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FNTBP49356 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FNTBP49356 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FNTBP49356 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FNTBP49356 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FNTBP49356 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FNTBP49356 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FNTBP49356 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FNTBP49356 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FNTBP49356 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FNTBP49356 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FNTBP49356 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FNTBP49356 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FNTBP49356 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FNTBP49356 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FNTBP49356 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FNTBP49356 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FNTBP49356 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FNTBP49356 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FNTBP49356 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FNTBP49356 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FNTBP49356 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FNTBP49356 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FNTBP49356 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FNTBP49356 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FNTBP49356 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FNTBP49356 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
FNTBP49356 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FNTBP49356 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FNTBP49356 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FNTBP49356 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FNTBP49356 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FNTBP49356 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
FNTBP49356 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FNTBP49356 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FNTBP49356 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FNTBP49356 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FNTBP49356 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FNTBP49356 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FNTBP49356 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FNTBP49356 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FNTBP49356 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
FNTBP49356 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FNTBP49356 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FNTBP49356 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FNTBP49356 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FNTBP49356 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FNTBP49356 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FNTBP49356 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FNTBP49356 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FNTBP49356 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FNTBP49356 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FNTBP49356 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FNTBP49356 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
FNTBP49356 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FNTBP49356 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FNTBP49356 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
FNTBP49356 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FNTBP49356 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FNTBP49356 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FNTBP49356 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FNTBP49356 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FNTBP49356 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FNTBP49356 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FNTBP49356 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
FNTBP49356 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
FNTBP49356 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FNTBP49356 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FNTBP49356 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FNTBP49356 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FNTBP49356 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
FNTBP49356 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FNTBP49356 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FNTBP49356 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FNTBP49356 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
FNTBP49356 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms