Protein–RNA interactions for Protein: P48730

CSNK1D, Casein kinase I isoform delta, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1DP48730 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSNK1DP48730 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSNK1DP48730 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSNK1DP48730 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CSNK1DP48730 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSNK1DP48730 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSNK1DP48730 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSNK1DP48730 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSNK1DP48730 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSNK1DP48730 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSNK1DP48730 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSNK1DP48730 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CSNK1DP48730 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CSNK1DP48730 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CSNK1DP48730 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CSNK1DP48730 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CSNK1DP48730 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CSNK1DP48730 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CSNK1DP48730 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CSNK1DP48730 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CSNK1DP48730 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CSNK1DP48730 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CSNK1DP48730 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CSNK1DP48730 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CSNK1DP48730 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CSNK1DP48730 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CSNK1DP48730 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CSNK1DP48730 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CSNK1DP48730 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CSNK1DP48730 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CSNK1DP48730 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CSNK1DP48730 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CSNK1DP48730 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CSNK1DP48730 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CSNK1DP48730 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CSNK1DP48730 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CSNK1DP48730 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CSNK1DP48730 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CSNK1DP48730 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CSNK1DP48730 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CSNK1DP48730 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CSNK1DP48730 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CSNK1DP48730 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CSNK1DP48730 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CSNK1DP48730 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CSNK1DP48730 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CSNK1DP48730 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CSNK1DP48730 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CSNK1DP48730 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CSNK1DP48730 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CSNK1DP48730 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CSNK1DP48730 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CSNK1DP48730 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CSNK1DP48730 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CSNK1DP48730 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CSNK1DP48730 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CSNK1DP48730 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CSNK1DP48730 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CSNK1DP48730 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CSNK1DP48730 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CSNK1DP48730 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CSNK1DP48730 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CSNK1DP48730 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CSNK1DP48730 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CSNK1DP48730 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CSNK1DP48730 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CSNK1DP48730 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CSNK1DP48730 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
CSNK1DP48730 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CSNK1DP48730 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CSNK1DP48730 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CSNK1DP48730 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CSNK1DP48730 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSNK1DP48730 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CSNK1DP48730 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSNK1DP48730 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSNK1DP48730 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSNK1DP48730 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSNK1DP48730 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSNK1DP48730 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSNK1DP48730 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSNK1DP48730 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CSNK1DP48730 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CSNK1DP48730 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CSNK1DP48730 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CSNK1DP48730 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CSNK1DP48730 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CSNK1DP48730 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CSNK1DP48730 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CSNK1DP48730 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSNK1DP48730 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSNK1DP48730 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CSNK1DP48730 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSNK1DP48730 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CSNK1DP48730 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CSNK1DP48730 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CSNK1DP48730 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CSNK1DP48730 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CSNK1DP48730 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSNK1DP48730 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms