Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NEDD4P46934 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NEDD4P46934 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
NEDD4P46934 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
NEDD4P46934 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NEDD4P46934 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC30.2■■■□□ 2.42
NEDD4P46934 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NEDD4P46934 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NEDD4P46934 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NEDD4P46934 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NEDD4P46934 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
NEDD4P46934 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NEDD4P46934 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
NEDD4P46934 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
NEDD4P46934 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NEDD4P46934 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NEDD4P46934 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NEDD4P46934 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NEDD4P46934 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
NEDD4P46934 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NEDD4P46934 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NEDD4P46934 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NEDD4P46934 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
NEDD4P46934 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NEDD4P46934 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NEDD4P46934 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NEDD4P46934 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NEDD4P46934 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NEDD4P46934 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NEDD4P46934 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NEDD4P46934 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NEDD4P46934 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NEDD4P46934 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NEDD4P46934 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NEDD4P46934 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NEDD4P46934 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NEDD4P46934 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NEDD4P46934 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NEDD4P46934 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NEDD4P46934 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NEDD4P46934 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NEDD4P46934 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NEDD4P46934 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NEDD4P46934 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NEDD4P46934 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NEDD4P46934 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NEDD4P46934 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NEDD4P46934 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NEDD4P46934 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NEDD4P46934 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NEDD4P46934 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NEDD4P46934 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NEDD4P46934 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NEDD4P46934 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NEDD4P46934 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NEDD4P46934 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NEDD4P46934 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
NEDD4P46934 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NEDD4P46934 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NEDD4P46934 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NEDD4P46934 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NEDD4P46934 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
NEDD4P46934 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
NEDD4P46934 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NEDD4P46934 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NEDD4P46934 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NEDD4P46934 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NEDD4P46934 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NEDD4P46934 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
NEDD4P46934 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NEDD4P46934 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NEDD4P46934 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
NEDD4P46934 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NEDD4P46934 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NEDD4P46934 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NEDD4P46934 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NEDD4P46934 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NEDD4P46934 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NEDD4P46934 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NEDD4P46934 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NEDD4P46934 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NEDD4P46934 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NEDD4P46934 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
NEDD4P46934 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
NEDD4P46934 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
NEDD4P46934 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NEDD4P46934 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NEDD4P46934 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NEDD4P46934 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NEDD4P46934 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NEDD4P46934 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NEDD4P46934 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NEDD4P46934 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NEDD4P46934 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NEDD4P46934 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NEDD4P46934 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NEDD4P46934 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NEDD4P46934 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NEDD4P46934 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NEDD4P46934 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms