Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATRXP46100 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATRXP46100 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATRXP46100 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATRXP46100 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATRXP46100 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATRXP46100 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATRXP46100 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATRXP46100 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATRXP46100 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATRXP46100 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ATRXP46100 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATRXP46100 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATRXP46100 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATRXP46100 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATRXP46100 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATRXP46100 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ATRXP46100 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATRXP46100 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATRXP46100 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATRXP46100 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATRXP46100 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATRXP46100 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATRXP46100 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATRXP46100 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATRXP46100 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATRXP46100 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATRXP46100 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATRXP46100 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATRXP46100 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATRXP46100 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATRXP46100 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATRXP46100 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATRXP46100 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATRXP46100 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATRXP46100 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATRXP46100 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATRXP46100 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATRXP46100 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATRXP46100 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATRXP46100 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATRXP46100 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATRXP46100 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATRXP46100 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATRXP46100 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATRXP46100 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATRXP46100 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATRXP46100 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATRXP46100 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATRXP46100 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATRXP46100 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATRXP46100 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATRXP46100 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATRXP46100 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATRXP46100 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATRXP46100 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATRXP46100 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATRXP46100 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATRXP46100 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATRXP46100 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ATRXP46100 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATRXP46100 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATRXP46100 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATRXP46100 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATRXP46100 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATRXP46100 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATRXP46100 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATRXP46100 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATRXP46100 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATRXP46100 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATRXP46100 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATRXP46100 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATRXP46100 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATRXP46100 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATRXP46100 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ATRXP46100 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATRXP46100 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATRXP46100 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATRXP46100 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATRXP46100 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATRXP46100 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATRXP46100 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATRXP46100 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATRXP46100 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATRXP46100 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATRXP46100 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATRXP46100 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATRXP46100 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATRXP46100 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATRXP46100 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATRXP46100 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ATRXP46100 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATRXP46100 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATRXP46100 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATRXP46100 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATRXP46100 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATRXP46100 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATRXP46100 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATRXP46100 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATRXP46100 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms