Protein–RNA interactions for Protein: P45844

ABCG1, ATP-binding cassette sub-family G member 1, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCG1P45844 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCG1P45844 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCG1P45844 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCG1P45844 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCG1P45844 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCG1P45844 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCG1P45844 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCG1P45844 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCG1P45844 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ABCG1P45844 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ABCG1P45844 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ABCG1P45844 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ABCG1P45844 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ABCG1P45844 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCG1P45844 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCG1P45844 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCG1P45844 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCG1P45844 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCG1P45844 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ABCG1P45844 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ABCG1P45844 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCG1P45844 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCG1P45844 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCG1P45844 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCG1P45844 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCG1P45844 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCG1P45844 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCG1P45844 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCG1P45844 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCG1P45844 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCG1P45844 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCG1P45844 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ABCG1P45844 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ABCG1P45844 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ABCG1P45844 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ABCG1P45844 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ABCG1P45844 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ABCG1P45844 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ABCG1P45844 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ABCG1P45844 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ABCG1P45844 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCG1P45844 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCG1P45844 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCG1P45844 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCG1P45844 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCG1P45844 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCG1P45844 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ABCG1P45844 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCG1P45844 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCG1P45844 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCG1P45844 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ABCG1P45844 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCG1P45844 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCG1P45844 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCG1P45844 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCG1P45844 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCG1P45844 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCG1P45844 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCG1P45844 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCG1P45844 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ABCG1P45844 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ABCG1P45844 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ABCG1P45844 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCG1P45844 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCG1P45844 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCG1P45844 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCG1P45844 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCG1P45844 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCG1P45844 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCG1P45844 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCG1P45844 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCG1P45844 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCG1P45844 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCG1P45844 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCG1P45844 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCG1P45844 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCG1P45844 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCG1P45844 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCG1P45844 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCG1P45844 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCG1P45844 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCG1P45844 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCG1P45844 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCG1P45844 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCG1P45844 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCG1P45844 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCG1P45844 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCG1P45844 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCG1P45844 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCG1P45844 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCG1P45844 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCG1P45844 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCG1P45844 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCG1P45844 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCG1P45844 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCG1P45844 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCG1P45844 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCG1P45844 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCG1P45844 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCG1P45844 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms