Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
KDM5CP41229 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
KDM5CP41229 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.95■■■■□ 3.83
KDM5CP41229 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC38.95■■■■□ 3.83
KDM5CP41229 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
KDM5CP41229 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC38.94■■■■□ 3.82
KDM5CP41229 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
KDM5CP41229 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
KDM5CP41229 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
KDM5CP41229 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
KDM5CP41229 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
KDM5CP41229 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC38.91■■■■□ 3.82
KDM5CP41229 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
KDM5CP41229 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC38.91■■■■□ 3.82
KDM5CP41229 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.91■■■■□ 3.82
KDM5CP41229 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
KDM5CP41229 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC38.89■■■■□ 3.82
KDM5CP41229 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
KDM5CP41229 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC38.88■■■■□ 3.81
KDM5CP41229 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.81
KDM5CP41229 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
KDM5CP41229 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.88■■■■□ 3.81
KDM5CP41229 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
KDM5CP41229 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
KDM5CP41229 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
KDM5CP41229 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
KDM5CP41229 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
KDM5CP41229 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
KDM5CP41229 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
KDM5CP41229 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
KDM5CP41229 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.85■■■■□ 3.81
KDM5CP41229 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC38.85■■■■□ 3.81
KDM5CP41229 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
KDM5CP41229 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC38.85■■■■□ 3.81
KDM5CP41229 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
KDM5CP41229 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
KDM5CP41229 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
KDM5CP41229 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC38.83■■■■□ 3.81
KDM5CP41229 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
KDM5CP41229 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.8■■■■□ 3.8
KDM5CP41229 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
KDM5CP41229 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.78■■■■□ 3.8
KDM5CP41229 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
KDM5CP41229 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
KDM5CP41229 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
KDM5CP41229 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC38.76■■■■□ 3.8
KDM5CP41229 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
KDM5CP41229 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
KDM5CP41229 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
KDM5CP41229 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC38.74■■■■□ 3.79
KDM5CP41229 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
KDM5CP41229 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC38.74■■■■□ 3.79
KDM5CP41229 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC38.74■■■■□ 3.79
KDM5CP41229 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC38.73■■■■□ 3.79
KDM5CP41229 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC38.73■■■■□ 3.79
KDM5CP41229 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC38.71■■■■□ 3.79
KDM5CP41229 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC38.71■■■■□ 3.79
KDM5CP41229 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
KDM5CP41229 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
KDM5CP41229 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
KDM5CP41229 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
KDM5CP41229 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
KDM5CP41229 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
KDM5CP41229 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC38.67■■■■□ 3.78
KDM5CP41229 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
KDM5CP41229 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC38.67■■■■□ 3.78
KDM5CP41229 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
KDM5CP41229 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC38.66■■■■□ 3.78
KDM5CP41229 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
KDM5CP41229 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
KDM5CP41229 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
KDM5CP41229 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
KDM5CP41229 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC38.65■■■■□ 3.78
KDM5CP41229 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.65■■■■□ 3.78
KDM5CP41229 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
KDM5CP41229 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC38.65■■■■□ 3.78
KDM5CP41229 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC38.64■■■■□ 3.78
KDM5CP41229 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC38.63■■■■□ 3.77
KDM5CP41229 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC38.62■■■■□ 3.77
KDM5CP41229 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC38.62■■■■□ 3.77
KDM5CP41229 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC38.61■■■■□ 3.77
KDM5CP41229 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC38.61■■■■□ 3.77
KDM5CP41229 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC38.61■■■■□ 3.77
KDM5CP41229 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
KDM5CP41229 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.61■■■■□ 3.77
KDM5CP41229 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
KDM5CP41229 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
KDM5CP41229 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
KDM5CP41229 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
KDM5CP41229 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC38.59■■■■□ 3.77
KDM5CP41229 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
KDM5CP41229 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC38.59■■■■□ 3.77
KDM5CP41229 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
KDM5CP41229 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.76
KDM5CP41229 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC38.56■■■■□ 3.76
KDM5CP41229 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
KDM5CP41229 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
KDM5CP41229 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
KDM5CP41229 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
KDM5CP41229 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC38.56■■■■□ 3.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms