Protein–RNA interactions for Protein: P40318

SSM4, ERAD-associated E3 ubiquitin-protein ligase DOA10, yeastyeast

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Length 1,319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSM4P40318 AOS1YPR180W 1044 nt10.94□□□□□ -0.66
SSM4P40318 STE3YKL178C 1413 nt10.93□□□□□ -0.66
SSM4P40318 HBS1YKR084C 1836 nt10.92□□□□□ -0.66
SSM4P40318 YNL295WYNL295W 1575 nt10.91□□□□□ -0.66
SSM4P40318 DUR3YHL016C 2208 nt10.91□□□□□ -0.66
SSM4P40318 SPS1YDR523C 1473 nt10.9□□□□□ -0.67
SSM4P40318 YGR137WYGR137W 375 nt10.89□□□□□ -0.67
SSM4P40318 YPL247CYPL247C 1572 nt10.89□□□□□ -0.67
SSM4P40318 KTR4YBR199W 1395 nt10.89□□□□□ -0.67
SSM4P40318 CRN1YLR429W 1956 nt10.88□□□□□ -0.67
SSM4P40318 UME1YPL139C 1383 nt10.88□□□□□ -0.67
SSM4P40318 CPR2YHR057C 618 nt10.86□□□□□ -0.67
SSM4P40318 ERV2YPR037C 591 nt10.85□□□□□ -0.67
SSM4P40318 RRP43YCR035C 1185 nt10.84□□□□□ -0.67
SSM4P40318 PSA1YDL055C 1086 nt10.84□□□□□ -0.67
SSM4P40318 DOC1YGL240W 753 nt10.84□□□□□ -0.67
SSM4P40318 CYS3YAL012W 1185 nt10.84□□□□□ -0.67
SSM4P40318 VPS65YLR322W 315 nt10.84□□□□□ -0.67
SSM4P40318 YJR142WYJR142W 1029 nt10.84□□□□□ -0.67
SSM4P40318 ADH6YMR318C 1083 nt10.84□□□□□ -0.67
SSM4P40318 SDH8YBR269C 417 nt10.84□□□□□ -0.67
SSM4P40318 NMA2YGR010W 1188 nt10.83□□□□□ -0.68
SSM4P40318 CDA1YLR307W 906 nt10.83□□□□□ -0.68
SSM4P40318 TES1YJR019C 1050 nt10.82□□□□□ -0.68
SSM4P40318 YOR072WYOR072W 315 nt10.81□□□□□ -0.68
SSM4P40318 YPC1YBR183W 951 nt10.81□□□□□ -0.68
SSM4P40318 INP54YOL065C 1155 nt10.79□□□□□ -0.68
SSM4P40318 PMT1YDL095W 2454 nt10.78□□□□□ -0.68
SSM4P40318 YML079WYML079W 606 nt10.78□□□□□ -0.68
SSM4P40318 HOG1YLR113W 1308 nt10.77□□□□□ -0.69
SSM4P40318 PPZ2YDR436W 2133 nt10.77□□□□□ -0.69
SSM4P40318 ATP23YNR020C 813 nt10.77□□□□□ -0.69
SSM4P40318 MEX67YPL169C 1800 nt10.76□□□□□ -0.69
SSM4P40318 AVL9YLR114C 2295 nt10.76□□□□□ -0.69
SSM4P40318 RPR1RPR1 369 nt10.76□□□□□ -0.69
SSM4P40318 PIH1YHR034C 1035 nt10.75□□□□□ -0.69
SSM4P40318 OSM1YJR051W 1506 nt10.74□□□□□ -0.69
SSM4P40318 DUS3YLR401C 2007 nt10.74□□□□□ -0.69
SSM4P40318 MET13YGL125W 1803 nt10.73□□□□□ -0.69
SSM4P40318 SNA3YJL151C 402 nt10.73□□□□□ -0.69
SSM4P40318 ALD5YER073W 1563 nt10.73□□□□□ -0.69
SSM4P40318 DIA4YHR011W 1341 nt10.72□□□□□ -0.69
SSM4P40318 CDC3YLR314C 1563 nt10.71□□□□□ -0.69
SSM4P40318 PUP2YGR253C 783 nt10.71□□□□□ -0.69
SSM4P40318 STS1YIR011C 960 nt10.71□□□□□ -0.69
SSM4P40318 DAL80YKR034W 810 nt10.71□□□□□ -0.69
SSM4P40318 SKP1YDR328C 585 nt10.7□□□□□ -0.7
SSM4P40318 RPL2AYFR031C-A 765 nt10.7□□□□□ -0.7
SSM4P40318 YHR033WYHR033W 1272 nt10.7□□□□□ -0.7
SSM4P40318 CKB1YGL019W 837 nt10.68□□□□□ -0.7
SSM4P40318 YGL081WYGL081W 963 nt10.68□□□□□ -0.7
SSM4P40318 MBF1YOR298C-A 456 nt10.68□□□□□ -0.7
SSM4P40318 PDC5YLR134W 1692 nt10.68□□□□□ -0.7
SSM4P40318 YDR215CYDR215C 414 nt10.67□□□□□ -0.7
SSM4P40318 LEO1YOR123C 1395 nt10.66□□□□□ -0.7
SSM4P40318 RCF2YNR018W 675 nt10.66□□□□□ -0.7
SSM4P40318 MSI1YBR195C 1269 nt10.66□□□□□ -0.7
SSM4P40318 PDA1YER178W 1263 nt10.65□□□□□ -0.7
SSM4P40318 CKI1YLR133W 1749 nt10.64□□□□□ -0.71
SSM4P40318 HXK1YFR053C 1458 nt10.64□□□□□ -0.71
SSM4P40318 HRB1YNL004W 1365 nt10.64□□□□□ -0.71
SSM4P40318 PEX28YHR150W 1740 nt10.63□□□□□ -0.71
SSM4P40318 YAL019W-AYAL019W-A 570 nt10.63□□□□□ -0.71
SSM4P40318 GET2YER083C 858 nt10.62□□□□□ -0.71
SSM4P40318 COS10YNR075W 1125 nt10.62□□□□□ -0.71
SSM4P40318 YPQ1YOL092W 927 nt10.62□□□□□ -0.71
SSM4P40318 YPT10YBR264C 600 nt10.62□□□□□ -0.71
SSM4P40318 BDS1YOL164W 1941 nt10.62□□□□□ -0.71
SSM4P40318 SLM3YDL033C 1254 nt10.6□□□□□ -0.71
SSM4P40318 PRY2YKR013W 990 nt10.59□□□□□ -0.71
SSM4P40318 DSC3YOR223W 879 nt10.59□□□□□ -0.71
SSM4P40318 YBL111CYBL111C 2004 nt10.57□□□□□ -0.72
SSM4P40318 FIT1YDR534C 1587 nt10.57□□□□□ -0.72
SSM4P40318 OPI1YHL020C 1215 nt10.57□□□□□ -0.72
SSM4P40318 YPL067CYPL067C 597 nt10.56□□□□□ -0.72
SSM4P40318 PMT7YDR307W 1989 nt10.55□□□□□ -0.72
SSM4P40318 PET10YKR046C 852 nt10.55□□□□□ -0.72
SSM4P40318 MDH2YOL126C 1134 nt10.55□□□□□ -0.72
SSM4P40318 ADE16YLR028C 1776 nt10.54□□□□□ -0.72
SSM4P40318 HNM1YGL077C 1692 nt10.54□□□□□ -0.72
SSM4P40318 HSV2YGR223C 1347 nt10.54□□□□□ -0.72
SSM4P40318 TRR2YHR106W 1029 nt10.54□□□□□ -0.72
SSM4P40318 MAS2YHR024C 1449 nt10.53□□□□□ -0.72
SSM4P40318 CAR2YLR438W 1275 nt10.53□□□□□ -0.72
SSM4P40318 CST26YBR042C 1194 nt10.53□□□□□ -0.72
SSM4P40318 YBL113CYBL113C 2379 nt10.51□□□□□ -0.73
SSM4P40318 PIL1YGR086C 1020 nt10.51□□□□□ -0.73
SSM4P40318 SGF73YGL066W 1974 nt10.5□□□□□ -0.73
SSM4P40318 CCW12YLR110C 402 nt10.49□□□□□ -0.73
SSM4P40318 YOX1YML027W 1158 nt10.48□□□□□ -0.73
SSM4P40318 snR30snR30 606 nt10.48□□□□□ -0.73
SSM4P40318 YML122CYML122C 381 nt10.47□□□□□ -0.73
SSM4P40318 PTH2YBL057C 627 nt10.47□□□□□ -0.73
SSM4P40318 ZIM17YNL310C 525 nt10.47□□□□□ -0.73
SSM4P40318 RUP1YOR138C 2016 nt10.46□□□□□ -0.73
SSM4P40318 YAH1YPL252C 519 nt10.46□□□□□ -0.73
SSM4P40318 LAT1YNL071W 1449 nt10.45□□□□□ -0.74
SSM4P40318 RSC9YML127W 1746 nt10.45□□□□□ -0.74
SSM4P40318 MDL2YPL270W 2322 nt10.44□□□□□ -0.74
SSM4P40318 AIM46YHR199C 933 nt10.44□□□□□ -0.74
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